RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-240	ENST00000495293	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	COL21A1	Q96P44	957 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	TAAR6	Q96RI8	345 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	CGREF1	Q99674	301 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	APOL4	Q9BPW4	351 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	HES7	Q9BYE0	225 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	HHATL	Q9HCP6	504 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	CMTM6	Q9NX76	183 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF639	Q9UID6	485 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293		V9GYQ6	96 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	DUXA	A6NLW8	204 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	FAM166B	A8MTA8	275 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293		G3V3Y1	287 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293		M0R3G1	203 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	UPK1A	O00322	258 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	CXCR6	O00574	342 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	CCL21	O00585	134 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	UBE2C	O00762	179 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	T	O15178	435 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	LRRTM2	O43300	516 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	SLC19A2	O60779	497 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	PDE9A	O76083	593 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	CLPS	P04118	112 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	TPO	P07202	933 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	ALOX5	P09917	674 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	CCL3	P10147	92 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	NCK1	P16333	377 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF12	P17014	697 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	S1PR1	P21453	382 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	GDF1	P27539	372 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	GABRA3	P34903	492 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	SOAT1	P35610	550 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	PIGA	P37287	484 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	RFC3	P40938	356 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	UQCRFS1	P47985	274 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	RFX3	P48380	749 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	DNASE1L1	P49184	302 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	EMD	P50402	254 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF84	P51523	738 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	SMS	P52788	366 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	TMBIM6	P55061	237 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	DIO3	P55073	304 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	FBXW4	P57775	412 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	IL5RA	Q01344	420 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	IL1RL1	Q01638	556 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	SNTA1	Q13424	505 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	IL18R1	Q13478	541 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	PDE7A	Q13946	482 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	SCARB2	Q14108	478 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	GK3P	Q14409	553 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	PTGR1	Q14914	329 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	MED22	Q15528	200 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	TMEM64	Q6YI46	380 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	ADCK1	Q86TW2	530 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	FJX1	Q86VR8	437 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	PRR22	Q8IZ63	422 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	OR2L13	Q8N349	312 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	DPP10	Q8N608	796 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RBM39-240	ENST00000495293	OR7G2	Q8NG99	324 aa		4.05	□□□□□ -1.76

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