RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494333.1

RIF1-211, Transcript of replication timing regulatory factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RIF1, Length 743 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1-211ENST00000494333 A4GALTQ9NPC4 353 aa7.1□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 SLC52A3Q9NQ40 469 aa7.1□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 ASB6Q9NWX5 421 aa7.1□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa7.1□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 VAPAQ9P0L0 249 aa7.1□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 UPB1Q9UBR1 384 aa7.1□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 PRDM4Q9UKN5 801 aa7.1□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 LAMP3Q9UQV4 416 aa7.1□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 RNF115Q9Y4L5 304 aa7.1□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 HEATR5AQ86XA9 2040 aa7.1□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 A0A1W2PP18 115 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 A0A1W2PR80 420 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 LIPT2A6NK58 231 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 OR5H1A6NKK0 313 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 A8MVM7 634 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 EVPLLA8MZ36 301 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 DIRC3C9JPN6 131 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 F2RL2O00254 374 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 FRS3O43559 492 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 ETS2P15036 469 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 TNFRSF1AP19438 455 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 COX5AP20674 150 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 IDUAP35475 653 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 PTH2RP49190 550 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 HOXC5Q00444 222 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 SLC17A1Q14916 467 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 TSPO2Q5TGU0 170 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 C9orf135Q5VTT2 229 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 ADAM5Q6NVV9 412 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 PRSS57Q6UWY2 283 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 CASP12Q6UXS9 341 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 Q71RC1 249 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 BIVMQ86UB2 503 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 GPAT4Q86UL3 456 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 MSRB3Q8IXL7 192 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 C10orf111Q8N326 155 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 OR52E4Q8NGH9 312 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 OR52N5Q8NH56 324 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 NFKBIDQ8NI38 313 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 BBS10Q8TAM1 723 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 IGFBPL1Q8WX77 278 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 NEUROG1Q92886 237 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 MAGEB18Q96M61 343 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 MUS81Q96NY9 551 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 TAPBPLQ9BX59 468 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 RABEP2Q9H5N1 569 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 CXorf56Q9H5V9 222 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 VIPAS39Q9H9C1 493 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 TMEM45AQ9NWC5 275 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 ADPRHL2Q9NX46 363 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 TAS2R16Q9NYV7 291 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa7.09□□□□□ -1.27
RIF1-211ENST00000494333 AQP7P3A6NL99 342 aa7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 H7C1Q1 480 aa7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 ABCD4O14678 606 aa7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 TPST1O60507 370 aa7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 SOD3P08294 240 aa7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 DANCRP0C864 163 aa7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 GPX2P18283 190 aa7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 NR4A1P22736 598 aa7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 PPIBP23284 216 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 GCSHP23434 173 aa7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 ATP4BP51164 291 aa7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 ATP5J2P56134 94 aa7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 CDK6Q00534 326 aa7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 SQLEQ14534 574 aa7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 GABRA6Q16445 453 aa7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 GCNT6Q5T4J0 391 aa7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 C1orf140Q5VVS0 124 aa7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 OR7E24Q6IFN5 339 aa7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 REEP3Q6NUK4 255 aa7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 DLEU7Q6UYE1 221 aa7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 SSX8Q7RTT4 187 aa7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 AAED1Q7RTV5 226 aa7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 FITM2Q8N6M3 262 aa7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 ZIC4Q8N9L1 334 aa7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 KBTBD8Q8NFY9 601 aa7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 SLC35B4Q969S0 331 aa7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 C3orf49Q96BT1 292 aa7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 SLC25A36Q96CQ1 311 aa7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 TRIM2Q9C040 744 aa7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 IKZF5Q9H5V7 419 aa7.08□□□□□ -1.28
RIF1-211ENST00000494333 SLC7A10Q9NS82 523 aa7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms