RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC126Q96EE4 140 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 RASL11BQ9BPW5 248 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 DEFB127Q9H1M4 99 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 EXO5Q9H790 373 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM185BQ9H7F4 350 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 NANOGQ9H9S0 305 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 XCL2Q9UBD3 114 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 GNPTGQ9UJJ9 305 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 PITPNC1Q9UKF7 332 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 NINLQ9Y2I6 1382 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0G2JN53 185 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 GJE1A6NN92 205 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 FAM189A1O60320 539 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 DFNA5O60443 496 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 NPIPB7O75200 414 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 CDH16O75309 829 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 ALDOBP05062 364 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 GIPP09681 153 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 FOXN2P32314 431 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 GBE1Q04446 702 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA0087Q14695 138 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 CTRB2Q6GPI1 263 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 SASS6Q6UVJ0 657 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 C6orf89Q6UWU4 347 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 NIPA1Q7RTP0 329 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 MS4A15Q8N5U1 240 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 ACMSDQ8TDX5 336 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 ATP5SQ99766 215 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 ECSITQ9BQ95 431 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 C20orf24Q9BUV8 137 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF160Q9HCG1 818 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 MMP26Q9NRE1 261 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-212ENST00000491302 MSH6P52701 1360 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 AIM2O14862 343 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF19P17023 458 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 ATP5OP48047 213 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC10Q5BKY1 277 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 LUZP2Q86TE4 346 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM61Q8N0U2 210 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 SUMF2Q8NBJ7 301 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 SLC22A8Q8TCC7 542 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 CXorf40AQ8TE69 158 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 RARRES2Q99969 163 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 RACGAP1Q9H0H5 632 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 ATRXP46100 2492 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 PPP1R2P9O14990 202 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 KLHL41O60662 606 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 OR2J3O76001 311 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 H6PDO95479 791 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 FGGP02679 453 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 TDGF1P13385 188 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 SLC26A3P40879 764 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 TDGF1P3P51864 188 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 RPS15P62841 145 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 C9orf135Q5VTT2 229 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 CERS6Q6ZMG9 384 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF836Q6ZNA1 936 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 C11orf53Q8IXP5 236 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 EID2Q8N6I1 236 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 OR2G3Q8NGZ4 309 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 SDR42E1Q8WUS8 393 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 MED8Q96G25 268 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 SH3GL3Q99963 347 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 CCL28Q9NRJ3 127 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0B4J2A0 478 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0G2JLM5 398 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 OR2AG2A6NM03 316 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 ERVV-1B6SEH8 477 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 RAB29O14966 203 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 CACNG3O60359 315 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 GKN3PP0CG01 181 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 BTCP35070 178 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 NSG1P42857 185 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 RFX3P48380 749 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 SSR4P51571 173 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 H2AFVQ71UI9 128 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 KIR2DL5AQ8N109 375 aa5.31□□□□□ -1.56
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