RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	APMAP	Q9HDC9	416 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	FANCF	Q9NPI8	374 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	MOK	Q9UQ07	419 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	POLH	Q9Y253	713 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC30A4	O14863	429 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF208	O43345	1280 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	HCRTR2	O43614	444 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	PLPP2	O43688	288 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CBFA2T3	O75081	653 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SC5D	O75845	299 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	KNG1	P01042	644 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	IGHE	P01854	428 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	HLA-DPB1	P04440	258 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	UMOD	P07911	640 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2T7	P0C7T2	308 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	HSMCR30	P0CW71	290 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	GP1BB	P13224	206 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	NR4A1	P22736	598 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TACR3	P29371	465 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	AVPR2	P30518	371 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	PTGDS	P41222	190 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SOX3	P41225	446 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CENPA	P49450	140 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	PPP5C	P53041	499 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF45	Q02386	682 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ZP4	Q12836	540 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SNTA1	Q13424	505 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	PCOLCE	Q15113	449 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ANGPT1	Q15389	498 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TRAM1	Q15629	374 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	EXT1	Q16394	746 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SGCB	Q16585	318 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	NTRK2	Q16620	822 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	LCN10	Q6JVE6	187 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247		Q6ZNX1	250 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TRIL	Q7L0X0	811 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	MARCH3	Q86UD3	253 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC190	Q86UF4	302 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	GGN	Q86UU5	652 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	PRR22	Q8IZ63	422 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SCAI	Q8N9R8	606 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TEX19	Q8NA77	164 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2T27	Q8NH04	317 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	OR51A7	Q8NH64	312 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	MCFD2	Q8NI22	146 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	M1AP	Q8TC57	530 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM234	Q8WY98	164 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	UFD1	Q92890	307 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TMCO6	Q96DC7	493 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	MNT	Q99583	582 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	DDA1	Q9BW61	102 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	NANS	Q9NR45	359 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SSR3	Q9UNL2	185 aa		5	□□□□□ -1.61

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