RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 NAE1Q13564 534 aa7□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 GRHL2Q6ISB3 625 aa7□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 DEF8Q6ZN54 512 aa7□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 SPAG16Q8N0X2 631 aa7□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 TGM7Q96PF1 710 aa7□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 IL4I1Q96RQ9 567 aa7□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 ACPTQ9BZG2 426 aa7□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 STRADBQ9C0K7 418 aa7□□□□□ -1.29
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USP4-211ENST00000485450 SH2B3Q9UQQ2 575 aa7□□□□□ -1.29
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USP4-211ENST00000485450 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa7□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 ARRDC5A6NEK1 342 aa7□□□□□ -1.29
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USP4-211ENST00000485450 RAB36O95755 333 aa7□□□□□ -1.29
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USP4-211ENST00000485450 CD22P20273 847 aa7□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 STAT5AP42229 794 aa7□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 CDH12P55289 794 aa7□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 GFERP55789 205 aa7□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 RAB5BP61020 215 aa7□□□□□ -1.29
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USP4-211ENST00000485450 PRR5P85299 388 aa7□□□□□ -1.29
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USP4-211ENST00000485450 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 SLC30A6Q6NXT4 461 aa7□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa7□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa7□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 VN1R4Q7Z5H5 301 aa7□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 C5orf24Q7Z6I8 188 aa7□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 OAFQ86UD1 273 aa7□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 COMTD1Q86VU5 262 aa7□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 SERPINA12Q8IW75 414 aa7□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 GPR135Q8IZ08 494 aa7□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 AGBL5Q8NDL9 886 aa7□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 FAM71CQ8NEG0 241 aa7□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 OR52J3Q8NH60 311 aa7□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 HUS1BQ8NHY5 278 aa7□□□□□ -1.29
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USP4-211ENST00000485450 ZNF559Q9BR84 538 aa7□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 MESP1Q9BRJ9 268 aa7□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 TSSK6Q9BXA6 273 aa7□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa7□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 CBLCQ9ULV8 474 aa7□□□□□ -1.29
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USP4-211ENST00000485450 H0YIG0 161 aa6.99□□□□□ -1.29
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USP4-211ENST00000485450 SC5DO75845 299 aa6.99□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 GATBO75879 557 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 HIST1H2ABP04908 130 aa6.99□□□□□ -1.29
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USP4-211ENST00000485450 RAB4AP20338 218 aa6.99□□□□□ -1.29
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USP4-211ENST00000485450 CCR6P51684 374 aa6.99□□□□□ -1.29
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USP4-211ENST00000485450 Q6ZTK2 550 aa6.99□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa6.99□□□□□ -1.29
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USP4-211ENST00000485450 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa6.99□□□□□ -1.29
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USP4-211ENST00000485450 DUSP19Q8WTR2 217 aa6.99□□□□□ -1.29
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USP4-211ENST00000485450 TEX12Q9BXU0 123 aa6.99□□□□□ -1.29
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USP4-211ENST00000485450 LRTM1Q9HBL6 345 aa6.99□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 C19orf12Q9NSK7 152 aa6.99□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 SLC22A14Q9Y267 594 aa6.99□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 LOXL2Q9Y4K0 774 aa6.99□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 CLDN16Q9Y5I7 305 aa6.99□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 LRRTM2O43300 516 aa6.99□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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USP4-211ENST00000485450 CTSVO60911 334 aa6.99□□□□□ -1.29
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USP4-211ENST00000485450 SELENOWP63302 87 aa6.99□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 POU4F2Q12837 409 aa6.99□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 OR8G1Q15617 311 aa6.99□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 ZSWIM7Q19AV6 140 aa6.99□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.99□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 GCNT6Q5T4J0 391 aa6.99□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 CEACAM20Q6UY09 585 aa6.99□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 SPNS3Q6ZMD2 512 aa6.99□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 GPSM1Q86YR5 675 aa6.99□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 SIAH3Q8IW03 269 aa6.99□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 OR10K1Q8NGX5 313 aa6.99□□□□□ -1.29
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