RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PRG6	482 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880		E7EQL1	145 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880		J3KTA2	159 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	FZD7	O75084	574 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	OR7A10	O76100	309 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	BCL10	O95999	233 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	CRYAA	P02489	173 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	F13B	P05160	661 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	IFI30	P13284	250 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	B4GALT1	P15291	398 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	CLRN1	P58418	232 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	PGGHG	Q32M88	737 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	GLYAT	Q6IB77	296 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF566	Q969W8	418 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	GSX2	Q9BZM3	304 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	VPS13C	Q709C8	3753 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	TRIM64B	A6NI03	449 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880		H7C1Q1	480 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	DANCR	P0C864	163 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	THRB	P10828	461 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	AQP2	P41181	271 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	PIGF	Q07326	219 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	TRAM2	Q15035	370 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	CBLL1	Q75N03	491 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	RRM2B	Q7LG56	351 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	MUC15	Q8N387	334 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	HLA-H	P01893	362 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	TTK	P33981	857 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	MYBPC1	Q00872	1141 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	ZP4	Q12836	540 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	FGD3	Q5JSP0	725 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	MDP1	Q86V88	176 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	CDK20	Q8IZL9	346 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	SYT14	Q8NB59	555 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	HTRA1	Q92743	480 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	FBXO17	Q96EF6	278 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	C18orf12	Q96KH6	178 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	LRR1	Q96L50	414 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	BDH2	Q9BUT1	245 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	NELFA	Q9H3P2	528 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	DLL4	Q9NR61	685 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	INIP	Q9NRY2	104 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	GLTP	Q9NZD2	209 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	NF1	P21359	2839 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	ZAN	Q9Y493	2812 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	IGHG1	P01857	330 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	CELA3B	P08861	270 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	CECR9	P0C854	216 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34

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