RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468913.2

C1orf50-202, Transcript of chromosome 1 open reading frame 50, humanhuman

TSL 5

Gene C1orf50, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50-202ENST00000468913 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 UPB1Q9UBR1 384 aa6.76□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 NDRG3Q9UGV2 375 aa6.76□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 PRSS50Q9UI38 385 aa6.76□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 EML6Q6ZMW3 1958 aa6.76□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 NCKAP5O14513 1909 aa6.76□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 TENM4Q6N022 2769 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 MED12Q93074 2177 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 TRAV27A0A087WT01 109 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 TUBAL3A6NHL2 446 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 UNC119BA6NIH7 251 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 CENPBD1B2RD01 187 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 CDC42EP2O14613 210 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 E2F6O75461 281 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 SERPINI2O75830 405 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 NDUFB2O95178 105 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 IGHV3-9P01782 118 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 F13BP05160 661 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 FCGR1AP12314 374 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 COX6B1P14854 86 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 COX5AP20674 150 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 GSTM3P21266 225 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 IL32P24001 234 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 FASP25445 335 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 RPL4P36578 427 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 KIR2DL3P43628 341 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 GSSP48637 474 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 ARHGDIAP52565 204 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 TGFBR3Q03167 851 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 FAPQ12884 760 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 TSPAN31Q12999 210 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 FHL1Q13642 323 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 ACKR1Q16570 336 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 FAM205BPQ63HN1 556 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 ZFP1Q6P2D0 407 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 PGBD2Q6P3X8 592 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 SSX8Q7RTT4 187 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 C20orf196Q8IYI0 205 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 TMEM123Q8N131 208 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 GPR137CQ8N3F9 429 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 OR6N1Q8NGY5 312 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 GIPC3Q8TF64 312 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 FAM222BQ8WU58 562 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 NRBF2Q96F24 287 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 TXNDC15Q96J42 360 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 DACH2Q96NX9 599 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 GPA33Q99795 319 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 BDH2Q9BUT1 245 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 DGCR6LQ9BY27 220 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 TXNIPQ9H3M7 391 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 MCCC2Q9HCC0 563 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 MED29Q9NX70 200 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 VNN3Q9NY84 501 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 TAS2R16Q9NYV7 291 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 KCNN3Q9UGI6 736 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 MGAT4BQ9UQ53 548 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 SIGLEC7Q9Y286 467 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 U3KQV3 271 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa6.75□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 DNAJC13O75165 2243 aa6.74□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 CIB4A0PJX0 185 aa6.74□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 ARRDC5A6NEK1 342 aa6.74□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 A6NIZ1 184 aa6.74□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 MCIDASD6RGH6 385 aa6.74□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 ZNF587BE7ETH6 402 aa6.74□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa6.74□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 PDLIM1O00151 329 aa6.74□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 CASKO14936 926 aa6.74□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 UPK3AO75631 287 aa6.74□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 TIPRLO75663 272 aa6.74□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 GASTP01350 101 aa6.74□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 IGHG1P01857 330 aa6.74□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 CD14P08571 375 aa6.74□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 APEHP13798 732 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 ACADSP16219 412 aa6.74□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 IGHV1-2P23083 117 aa6.74□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 MPGP29372 298 aa6.74□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 GSTT1P30711 240 aa6.74□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 IST1P53990 364 aa6.74□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 BIDP55957 195 aa6.74□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 CTXN1P60606 82 aa6.74□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 RAP1BP61224 184 aa6.74□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 RPL27P61353 136 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 RAP1AP62834 184 aa6.74□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 COX10Q12887 443 aa6.74□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 STK11Q15831 433 aa6.74□□□□□ -1.33
C1orf50-202ENST00000468913 ATP6AP1Q15904 470 aa6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms