RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		15.58	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	GPR35	Q9HC97	309 aa		15.58	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		15.58	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	INIP	Q9NRY2	104 aa		15.58	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902		A0A096LPE4	126 aa		15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PPR1	153 aa		15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PPZ6	126 aa		15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	SEMG1	P04279	462 aa		15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	CD3E	P07766	207 aa		15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	PRPS1	P60891	318 aa		15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	TESK1	Q15569	626 aa		15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	ALG10	Q5BKT4	473 aa		15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	LCN8	Q6JVE9	175 aa		15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	SSX8	Q7RTT4	187 aa		15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	OR6X1	Q8NH79	312 aa		15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	LIPH	Q8WWY8	451 aa		15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	ZNF566	Q969W8	418 aa		15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	ASB9	Q96DX5	294 aa		15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	LRR1	Q96L50	414 aa		15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	ZNF347	Q96SE7	839 aa		15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	F8	P00451	2351 aa		15.57	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902		M0R1B8	84 aa		15.56	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	SEC14L2	O76054	403 aa		15.56	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	WNT11	O96014	354 aa		15.56	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	PLAU	P00749	431 aa		15.56	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	RRM2	P31350	389 aa		15.56	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	15.56	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	CLRN1	P58418	232 aa		15.56	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	BSPH1	Q075Z2	132 aa		15.56	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	15.56	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	KEAP1	Q14145	624 aa		15.56	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		15.56	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		15.56	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	15.56	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	WDR31	Q8NA23	367 aa		15.56	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	15.56	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	15.56	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	15.56	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		15.56	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	TRIM15	Q9C019	465 aa		15.56	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		15.56	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		15.56	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	AURKC	Q9UQB9	309 aa		15.56	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		15.56	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		15.56	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		15.56	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		15.55	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	DPRX	A6NFQ7	191 aa		15.55	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		15.55	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	15.55	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	DNASE1	P24855	282 aa		15.55	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	15.55	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	15.55	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	SLC9A3	P48764	834 aa		15.55	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	CHRNB3	Q05901	458 aa		15.55	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	BNIP1	Q12981	228 aa		15.55	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	SEC23B	Q15437	767 aa		15.55	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	ACKR1	Q16570	336 aa		15.55	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		15.55	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	15.55	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		15.55	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		15.55	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		15.55	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		15.55	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		15.55	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	15.55	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	GLTP	Q9NZD2	209 aa		15.55	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		15.55	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	15.55	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	IGHG1	P01857	330 aa		15.54	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	CAPZA2	P47755	286 aa		15.54	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	RASSF2	P50749	326 aa		15.54	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	CTXN1	P60606	82 aa		15.54	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	TUBA1B	P68363	451 aa		15.54	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	TUBA4A	P68366	448 aa		15.54	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	15.54	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		15.54	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	TUBA1A	Q71U36	451 aa		15.54	■□□□□ 0.08

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