RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF627	Q7L945	461 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	FNDC8	Q8TC99	324 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	SEPHS2	Q99611	448 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	GPR35	Q9HC97	309 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	MED29	Q9NX70	200 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	AKAP6	Q13023	2319 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	CAD	P27708	2225 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	FBN2	P35556	2912 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	CLOCK	O15516	846 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	UPK3A	O75631	287 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	WNT11	O96014	354 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	IGHG1	P01857	330 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	FUT4	P22083	530 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	RRM2	P31350	389 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	AQP2	P41181	271 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	OMP	P47874	163 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	LIMS1	P48059	325 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	BID	P55957	195 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	FHL1	Q13642	323 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	ZBED5	Q49AG3	693 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	ALG10	Q5BKT4	473 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF566	Q969W8	418 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	TXNDC15	Q96J42	360 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	YY1AP1	Q9H869	796 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	CRLF2	Q9HC73	371 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	POMP	Q9Y244	141 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	ROS1	P08922	2347 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	SIAH2	O43255	324 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	MGRN1	O60291	552 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	DIRAS1	O95057	198 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	PGA4	P0DJD7	388 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	PGA3	P0DJD8	388 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	CSNK1A1	P48729	337 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	12.84	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	TSC22D1	Q15714	1073 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	HIST3H3	Q16695	136 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	NRN1L	Q496H8	165 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	CDC20B	Q86Y33	519 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	OR52J3	Q8NH60	311 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	ASB10	Q8WXI3	467 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM54	Q969K7	222 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	GLTP	Q9NZD2	209 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	AURKC	Q9UQB9	309 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	PLCE1	Q9P212	2302 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	DHRS12	A0PJE2	317 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241		A6NIZ1	184 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	CDC42EP2	O14613	210 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	AHCYL1	O43865	530 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	PTP4A3	O75365	173 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	F13B	P05160	661 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	FPR3	P25089	353 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	GPR4	P46093	362 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	RAP1B	P61224	184 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	RAP1A	P62834	184 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	CAMK2D	Q13557	499 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	SEC23B	Q15437	767 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	ACKR1	Q16570	336 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		12.83	□□□□□ -0.36

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