RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-202ENST00000444658 GALEQ14376 348 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 POU4F3Q15319 338 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR7A5Q15622 319 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 ACKR1Q16570 336 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 LEG1Q6P5S2 330 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 SULF2Q8IWU5 870 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 BBS1Q8NFJ9 593 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q96M85 177 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 OXGR1Q96P68 337 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 OPALINQ96PE5 141 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR5M11Q96RB7 305 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 NMNAT3Q96T66 252 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 COQ7Q99807 217 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 HCAR1Q9BXC0 346 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 DCSTAMPQ9H295 470 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 MARCH7Q9H992 704 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 ACKR4Q9NPB9 350 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 NDUFB11Q9NX14 153 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 ERVK13-1Q9NX77 482 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 ARGFXA6NJG6 315 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 AQP7P3A6NL99 342 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 CLDN25C9JDP6 229 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 SULT2B1O00204 365 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 ADRA2AP08913 450 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 IL11P20809 199 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 GALP22466 123 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 AHCYP23526 432 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 ACVR1BP36896 505 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 ENTPD1P49961 510 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 ETV1P50549 477 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 GFRA1P56159 465 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 NCS1P62166 190 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 CDC20Q12834 499 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF846Q147U1 533 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 KLHL12Q53G59 568 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 MESTQ5EB52 335 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC01590Q5TEZ4 76 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGFL3Q6UXB1 125 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGFN1Q86VF2 1251 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM178AQ8NBL3 297 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 SDR9C7Q8NEX9 313 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 NDNFQ8TB73 568 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 ALG12Q9BV10 488 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR51V1Q9H2C8 321 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 ADGRL4Q9HBW9 690 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 KLHL1Q9NR64 748 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 ASB6Q9NWX5 421 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 ANKRD10Q9NXR5 420 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 BABAM2Q9NXR7 383 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 CLEC2DQ9UHP7 191 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 MSRB2Q9Y3D2 182 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 HEATR5AQ86XA9 2040 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 PCSK5Q92824 1860 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC22A23A1A5C7 686 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 H3BML4 177 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 CD1AP06126 327 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 RFPL3SP0C7P2 107 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 HSMCR30P0CW71 290 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 NR2C1P13056 603 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 TNFSF10P50591 281 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR2B6P58173 313 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 HSF1Q00613 529 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 SSX1Q16384 188 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 TSTQ16762 297 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF404Q494X3 552 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 THEM4Q5T1C6 240 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 PDSS1Q5T2R2 415 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 RAET1LQ5VY80 246 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM225Q6GV28 225 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC00696Q6ZRV3 163 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC35D2Q76EJ3 337 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 PHC2Q8IXK0 858 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 SYS1Q8N2H4 156 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 KLHL36Q8N4N3 616 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 CYB561A3Q8NBI2 242 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR4F15Q8NGB8 312 aa8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.7 ms