RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441439.6

LMO3-208, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,515 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-208ENST00000441439 OR1Q1Q15612 314 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 TMEM71Q6P5X7 295 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 OLIG3Q7RTU3 272 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 BAP18Q8IXM2 172 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 GALNT16Q8N428 558 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 PFN4Q8NHR9 129 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 DTD2Q96FN9 168 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 ZNF559Q9BR84 538 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 SLC17A9Q9BYT1 436 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 TWSG1Q9GZX9 223 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 EXO5Q9H790 373 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 NIT2Q9NQR4 276 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 PRDM7Q9NQW5 492 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 ASF1BQ9NVP2 202 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 COMMD9Q9P000 198 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 C5AR2Q9P296 337 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 LPAR3Q9UBY5 353 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 CLEC4EQ9ULY5 219 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 NTNG1Q9Y2I2 539 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 MED31Q9Y3C7 131 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 A0A0B4J2A0 478 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 UPK3AO75631 287 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 POU2F2P09086 479 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 NID1P14543 1247 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 MPIP34949 423 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 SLC9A5Q14940 896 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 C11orf96Q7Z7L8 435 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 LYG2Q86SG7 212 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 OR5K2Q8NHB8 316 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 CCDC74AQ96AQ1 378 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 SHPKQ9UHJ6 478 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 A0A0B4J2E0 115 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 A0A1B0GX12 115 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 A0A1W2PR48 441 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 C2orf74A8MZ97 194 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 ICOSLGO75144 302 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 ZFPL1O95159 310 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 FCGR3AP08637 254 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 CSNK1G2P78368 415 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 HTRA3P83110 453 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 DHRS2Q13268 280 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 LHX8Q68G74 356 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 SLC16A13Q7RTY0 426 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 TMEM200AQ86VY9 491 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 ZNF547Q8IVP9 402 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 ZNF619Q8N2I2 560 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 EXD3Q8N9H8 876 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 OR13C2Q8NGS9 318 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 DUSP19Q8WTR2 217 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 RSC1A1Q92681 617 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 CHST6Q9GZX3 395 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 IL21Q9HBE4 155 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 STARD7Q9NQZ5 370 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 CACFD1Q9UGQ2 172 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 YIPF1Q9Y548 306 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 LDB3O75112 727 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 PLGP00747 810 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 TACSTD2P09758 323 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 OR8U8P0C7N1 319 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 CLUP10909 449 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 CD34P28906 385 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 TACR3P29371 465 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 PRSS3P35030 304 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 ADH7P40394 386 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 CX3CR1P49238 355 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 SMCO1Q147U7 214 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 MEF2DQ14814 521 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 GFOD2Q3B7J2 385 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 C4orf46Q504U0 113 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-208ENST00000441439 RAB12Q6IQ22 244 aa7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms