RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 HSPB3Q12988 150 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 IRF4Q15306 451 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PGGHGQ32M88 737 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 STPG1Q5TH74 334 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 GLT8D1Q68CQ7 371 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 GRHL2Q6ISB3 625 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF813Q6ZN06 617 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ADCK2Q7Z695 626 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 NXPE1Q8N323 547 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 OR4C16Q8NGL9 310 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 XAGE5Q8WWM1 108 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 KLK6Q92876 244 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 C3orf49Q96BT1 292 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM169Q96HH4 297 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 OR14A2Q96R54 314 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PIGQQ9BRB3 760 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 TEX12Q9BXU0 123 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 EGLN1Q9GZT9 426 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 SLITRK2Q9H156 845 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC25A18Q9H1K4 315 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 S1PR5Q9H228 398 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 BRF2Q9HAW0 419 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 CDHR4A6H8M9 788 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF222A6NCQ9 220 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 HMGN4O00479 90 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 CLDN11O75508 207 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 KLHL18O94889 574 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 YIF1AO95070 293 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ADH1AP07327 375 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 COX5BP10606 129 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ALPPL2P10696 532 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 MNDAP41218 407 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 RBP2P50120 134 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 CDH4P55283 916 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PMP22Q01453 160 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 HYAL1Q12794 435 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF234Q14588 700 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAM1Q15629 374 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 MPPED2Q15777 294 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 NDUFAF6Q330K2 333 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 LY6G6FQ5SQ64 297 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ADAM5Q6NVV9 412 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 C6orf120Q7Z4R8 191 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF280BQ86YH2 543 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00471Q8N535 108 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 SYNPRQ8TBG9 265 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 SEC22AQ96IW7 307 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PRRC1Q96M27 445 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 LGR4Q9BXB1 951 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 HCAR1Q9BXC0 346 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 HRH4Q9H3N8 390 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 SUV39H2Q9H5I1 410 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 DMRT3Q9NQL9 472 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 CD207Q9UJ71 328 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 TNFSF18Q9UNG2 199 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 XKRY2A2RUG3 117 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 MEIS3P1A6NDR6 274 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 CCSO14618 274 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 RBBP9O75884 186 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2F2O95006 317 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 EPPINO95925 133 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 CSTBP04080 98 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 CDK2P24941 298 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 CERS1P27544 350 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 NRG3P56975 720 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 FOXO1Q12778 655 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2F1Q13607 317 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PDE7AQ13946 482 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PRRT3Q5FWE3 981 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 TUSC5Q8IXB3 177 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 SMRP1Q8NCR6 262 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 STEAP2Q8NFT2 490 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 OSTF1Q92882 214 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 SAMD8Q96LT4 415 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 OR51V1Q9H2C8 321 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 EXO5Q9H790 373 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 COMMD9Q9P000 198 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 TAAR2Q9P1P5 351 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 TRPC4Q9UBN4 977 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PISDQ9UG56 409 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 C2orf16Q68DN1 1984 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 GRXCR1A8MXD5 290 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ACOT7O00154 380 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms