RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
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PTPRU-204ENST00000428026 SSC5DA1L4H1 1573 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 PRSS44E7EML9 344 aa13.38□□□□□ -0.27
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PTPRU-204ENST00000428026 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
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PTPRU-204ENST00000428026 RPS15P62841 145 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 GLYATL3Q5SZD4 288 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 CHTF18Q8WVB6 975 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 SLCO4A1Q96BD0 722 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
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