RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419504.5

TNS1-205, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 5,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-205ENST00000419504 SPPL3Q8TCT6 385 aa12.1□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 FGF21Q9NSA1 209 aa12.1□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 KCNJ8Q15842 424 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 MAVSQ7Z434 540 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 TMEM106AQ96A25 262 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 EMC7Q9NPA0 242 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 DUSP22Q9NRW4 184 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 MYH4Q9Y623 1939 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 RAB19A4D1S5 217 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 H7C1C5 153 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 CTDSP2O14595 271 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 THBS1P07996 1170 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 CASP3P42574 277 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 LCN6P62502 163 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 ZNF74Q16587 644 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 LINC01465Q8N7H1 131 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 GJC3Q8NFK1 279 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 SELENOIQ9C0D9 397 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 OR52A1Q9UKL2 312 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 PLCH1Q4KWH8 1693 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 KLKB1P03952 638 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 C1orf140Q5VVS0 124 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 RNLSQ5VYX0 342 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 OVCH1Q7RTY7 1134 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 LAX1Q8IWV1 398 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 GPATCH2Q9NW75 528 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 SLC5A10A0PJK1 596 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 BCKDHBP21953 392 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 P2RX1P51575 399 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 ACSM1Q08AH1 577 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 ESCO2Q56NI9 601 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 BET1O15155 118 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 EMC4Q5J8M3 183 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 PRAMEF20Q5VT98 475 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 SMIM15Q7Z3B0 74 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 SLC35A4Q96G79 324 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 USP22Q9UPT9 525 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 SNX11Q9Y5W9 270 aa12.09□□□□□ -0.47
TNS1-205ENST00000419504 NRAPQ86VF7 1730 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 PMS2P2O95744 297 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 ELK1P19419 428 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 ACVR1Q04771 509 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 CRMP1Q14194 572 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 LRRC26Q2I0M4 334 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 RFLNAQ6ZTI6 216 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 GALNT9Q9HCQ5 603 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 SLAMF7Q9NQ25 335 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 ANKRD34BA5PLL1 514 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 GABARAPO95166 117 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 TEKQ02763 1124 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 NKAIN2Q5VXU1 208 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 NAXDQ8IW45 347 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 OR51A2Q8NGJ7 313 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 OLIG1Q8TAK6 271 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 BOD1Q96IK1 185 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 LYSMD1Q96S90 227 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 KCNJ15Q99712 375 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 ABHD6Q9BV23 337 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 OSGIN1Q9UJX0 560 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 LINC01553A4QN01 128 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 P2RY10O00398 339 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 ABHD16AO95870 558 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 HRH4Q9H3N8 390 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 GAREM1Q9H706 876 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 DECR2Q9NUI1 292 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 A6NIN4 97 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 AGAP14A8MT82 685 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 GABARAPH6UMI1 98 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 ACHEP22303 614 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 SHC1P29353 583 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 C9orf135Q5VTT2 229 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 STEAP1BQ6NZ63 245 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 MOB1AQ9H8S9 216 aa12.08□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 SOCS6O14544 535 aa12.07□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 TCN2P20062 427 aa12.07□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 RPL34P49207 117 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
TNS1-205ENST00000419504 RPL27P61353 136 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms