RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416748.1

NUP35P2-201, Transcript of nucleoporin 35 pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene NUP35P2, Length 943 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35P2-201ENST00000416748 BEX1Q9HBH7 125 aa3.41□□□□□ -1.86
NUP35P2-201ENST00000416748 AMBNQ9NP70 447 aa3.41□□□□□ -1.86
NUP35P2-201ENST00000416748 HRASLS2Q9NWW9 162 aa3.41□□□□□ -1.86
NUP35P2-201ENST00000416748 MS4A12Q9NXJ0 267 aa3.41□□□□□ -1.86
NUP35P2-201ENST00000416748 NDE1Q9NXR1 346 aa3.41□□□□□ -1.86
NUP35P2-201ENST00000416748 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
NUP35P2-201ENST00000416748 AUP1Q9Y679 476 aa3.41□□□□□ -1.86
NUP35P2-201ENST00000416748 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa3.41□□□□□ -1.86
NUP35P2-201ENST00000416748 A0A1B0GTH9 108 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 A0A1B0GVY2 172 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 A0A1W2PRF3 423 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 A0A1W2PRM7 423 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 FAM172BPA6NC97 362 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 FAM231BA6NCW3 169 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 RSPH10B2B2RC85 870 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 E9PLD3 99 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 CDC7O00311 574 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 DCTN6O00399 190 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 TFECO14948 347 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 SCRG1O75711 98 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 GPX5O75715 221 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 CST4P01036 141 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 SERPINB2P05120 415 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 RSPH10BP0C881 870 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 CT45A10P0DMU9 189 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 BGNP21810 368 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 SSR4P51571 173 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 ERVFC1-1P60608 527 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 ATP6V0D1P61421 351 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 CCDC173Q0VFZ6 552 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 PMS2P3Q13401 168 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 TRAM2Q15035 370 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 ZNF146Q15072 292 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 TRIM40Q6P9F5 258 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 EMBQ6PCB8 327 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 AKNAQ7Z591 1439 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 CMC1Q7Z7K0 106 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 ZFAND4Q86XD8 727 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 ZNF547Q8IVP9 402 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 ZBED8Q8IZ13 594 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 PDIK1LQ8N165 341 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 DNAAF3Q8N9W5 541 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 OR5B3Q8NH48 314 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 SSC4DQ8WTU2 575 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 TNFRSF14Q92956 283 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 NEIL2Q969S2 332 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 PSMG2Q969U7 264 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 RNF170Q96K19 258 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 LGMNQ99538 433 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 ANGPTL4Q9BY76 406 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 OCR1Q9BZK8 76 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 CWH43Q9H720 699 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 CD209Q9NNX6 404 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 QPCTLQ9NXS2 382 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 TMEM181Q9P2C4 612 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 SPRR3Q9UBC9 169 aa3.4□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 CNTNAP1P78357 1384 aa3.39□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa3.39□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 A0A1B0GW15 77 aa3.39□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 MPTX1A8MV57 137 aa3.39□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 PDHXO00330 501 aa3.39□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 SCN2BO60939 215 aa3.39□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 LCA5LO95447 670 aa3.39□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 LALBAP00709 142 aa3.39□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 IGHV2-5P01817 119 aa3.39□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 RPN2P04844 631 aa3.39□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 ACSM4P0C7M7 580 aa3.39□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 IVDP26440 423 aa3.39□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 EPHX2P34913 555 aa3.39□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 ARHGDIBP52566 201 aa3.39□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 RIDAP52758 137 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 ATP12AP54707 1039 aa3.39□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 MYL6P60660 151 aa3.39□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 LMO4P61968 165 aa3.39□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 CHRNB3Q05901 458 aa3.39□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 SLC10A7Q0GE19 358 aa3.39□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 C17orf58Q2M2W7 97 aa3.39□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 CNPY1Q3B7I2 92 aa3.39□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 TPRG1LQ5T0D9 272 aa3.39□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 UTF1Q5T230 341 aa3.39□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa3.39□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa3.39□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 RFWD3Q6PCD5 774 aa3.39□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa3.39□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 LINC00336Q6ZUF6 198 aa3.39□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 OR2W3Q7Z3T1 314 aa3.39□□□□□ -1.87
NUP35P2-201ENST00000416748 PLA2G4DQ86XP0 818 aa3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.2 ms