RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
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PGGT1B-202ENST00000379615 ALG10Q5BKT4 473 aa13.54□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 CARD17Q5XLA6 110 aa13.54□□□□□ -0.24
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PGGT1B-202ENST00000379615 C20orf196Q8IYI0 205 aa13.54□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM123Q8N131 208 aa13.54□□□□□ -0.24
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PGGT1B-202ENST00000379615 ALPK1Q96QP1 1244 aa13.54□□□□□ -0.24
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PGGT1B-202ENST00000379615 CSNK1A1P48729 337 aa13.53□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 HMGA2P52926 109 aa13.53□□□□□ -0.24
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PGGT1B-202ENST00000379615 PPA1Q15181 289 aa13.53□□□□□ -0.24
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PGGT1B-202ENST00000379615 C9orf135Q5VTT2 229 aa13.53□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM205BPQ63HN1 556 aa13.53□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 OR2T5Q6IEZ7 315 aa13.53□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 ALKBH2Q6NS38 261 aa13.53□□□□□ -0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 OR2T29Q8NH02 315 aa13.53□□□□□ -0.24
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PGGT1B-202ENST00000379615 REEP1Q9H902 201 aa13.53□□□□□ -0.24
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PGGT1B-202ENST00000379615 GPR35Q9HC97 309 aa13.53□□□□□ -0.24
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PGGT1B-202ENST00000379615 CLRN1P58418 232 aa13.52□□□□□ -0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 SEC23BQ15437 767 aa13.52□□□□□ -0.25
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PGGT1B-202ENST00000379615 ANKRD16Q6P6B7 361 aa13.52□□□□□ -0.25
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PGGT1B-202ENST00000379615 C22orf34Q6ZV56 151 aa13.52□□□□□ -0.25
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PGGT1B-202ENST00000379615 OR13C2Q8NGS9 318 aa13.52□□□□□ -0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 MOSPD2Q8NHP6 518 aa13.52□□□□□ -0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 PIK3IP1Q96FE7 263 aa13.52□□□□□ -0.25
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PGGT1B-202ENST00000379615 CHID1Q9BWS9 393 aa13.52□□□□□ -0.25
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PGGT1B-202ENST00000379615 SLC17A5Q9NRA2 495 aa13.52□□□□□ -0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 GLTPQ9NZD2 209 aa13.52□□□□□ -0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 POFUT2Q9Y2G5 429 aa13.52□□□□□ -0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 TRAV27A0A087WT01 109 aa13.51□□□□□ -0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 UNC119BA6NIH7 251 aa13.51□□□□□ -0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 A6NIZ1 184 aa13.51□□□□□ -0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 DEFB108AA8MXU0 73 aa13.51□□□□□ -0.25
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PGGT1B-202ENST00000379615 KLF4O43474 513 aa13.51□□□□□ -0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 CIB2O75838 187 aa13.51□□□□□ -0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 NDUFB2O95178 105 aa13.51□□□□□ -0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 OMPP47874 163 aa13.51□□□□□ -0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 CTXN1P60606 82 aa13.51□□□□□ -0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 RAP1BP61224 184 aa13.51□□□□□ -0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 RPL27P61353 136 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 RAP1AP62834 184 aa13.51□□□□□ -0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 ARF1P84077 181 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
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