RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356924.8

ABCD4-201, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ABCD4, Length 3,003 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-201ENST00000356924 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
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ABCD4-201ENST00000356924 FABP7O15540 132 aa10.05□□□□□ -0.8
ABCD4-201ENST00000356924 ITGA10O75578 1167 aa10.05□□□□□ -0.8
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ABCD4-201ENST00000356924 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
ABCD4-201ENST00000356924 RNFT2Q96EX2 444 aa10.05□□□□□ -0.8
ABCD4-201ENST00000356924 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
ABCD4-201ENST00000356924 FN3KQ9H479 309 aa10.05□□□□□ -0.8
ABCD4-201ENST00000356924 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
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ABCD4-201ENST00000356924 CHRNA9Q9UGM1 479 aa10.05□□□□□ -0.8
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ABCD4-201ENST00000356924 TAAR8Q969N4 342 aa10.04□□□□□ -0.8
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ABCD4-201ENST00000356924 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
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ABCD4-201ENST00000356924 CLEC2DQ9UHP7 191 aa10.04□□□□□ -0.8
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ABCD4-201ENST00000356924 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
ABCD4-201ENST00000356924 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
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ABCD4-201ENST00000356924 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa10.04□□□□□ -0.8
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ABCD4-201ENST00000356924 CXCR1P25024 350 aa10.04□□□□□ -0.8
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ABCD4-201ENST00000356924 MARCH9Q86YJ5 346 aa10.04□□□□□ -0.8
ABCD4-201ENST00000356924 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa10.04□□□□□ -0.8
ABCD4-201ENST00000356924 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa10.04□□□□□ -0.8
ABCD4-201ENST00000356924 MOSPD2Q8NHP6 518 aa10.04□□□□□ -0.8
ABCD4-201ENST00000356924 NTNG2Q96CW9 530 aa10.04□□□□□ -0.8
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ABCD4-201ENST00000356924 MARVELD1Q9BSK0 173 aa10.04□□□□□ -0.8
ABCD4-201ENST00000356924 MIXL1Q9H2W2 232 aa10.04□□□□□ -0.8
ABCD4-201ENST00000356924 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
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