RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF726A6NNF4 738 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 E7EQL1 145 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGEF9O43307 516 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF13O43567 381 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEC14L2O76054 403 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRSS23O95084 383 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIST1H2ABP04908 130 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 FUT1P19526 365 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP17.06■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 MELKQ14680 651 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 PGAM4Q8N0Y7 254 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKS4BQ8N8V4 417 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR6X1Q8NH79 312 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 LIPHQ8WWY8 451 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIST1H2ACQ93077 130 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCT8L2Q96SF2 557 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 RHCGQ9UBD6 479 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 OVOL3O00110 214 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 CSNK1A1P48729 337 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 FXNQ16595 210 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRSS57Q6UWY2 283 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 FKBP9P1Q75LS8 142 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 DTX2Q86UW9 622 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM156AQ8NDB6 213 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR6N1Q8NGY5 312 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM54Q969K7 222 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC38A2Q96QD8 506 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 FNDC11Q9BVV2 318 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 ULBP2Q9BZM5 246 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 POU2F3Q9UKI9 436 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa17.04■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa17.04■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGLV1-44P01699 117 aa17.04■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD8AP01732 235 aa17.04■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSPAN19P0C672 248 aa17.04■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 IFNA8P32881 189 aa17.04■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDKN1AP38936 164 aa17.04■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 AQP2P41181 271 aa17.04■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRAM2Q15035 370 aa17.04■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 GLYATQ6IB77 296 aa17.04■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF627Q7L945 461 aa17.04■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM86B1Q8N7N1 296 aa17.04■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 MOSPD2Q8NHP6 518 aa17.04■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 DHRS9Q9BPW9 319 aa17.04■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEC61A2Q9H9S3 476 aa17.04■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAIMQ9NVQ4 179 aa17.04■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPS6KA6Q9UK32 745 aa17.04■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGKV3-15P01624 115 aa17.03■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 F13BP05160 661 aa17.03■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 CECR9P0C854 216 aa17.03■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 PGA4P0DJD7 388 aa17.03■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 PGA3P0DJD8 388 aa17.03■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 IFI30P13284 250 aa17.03■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSD17B1P14061 328 aa17.03■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 PAX7P23759 505 aa17.03■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP5J2P56134 94 aa17.03■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 NRMQ8IXM6 262 aa17.03■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 DEPDC4Q8N2C3 294 aa17.03■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 FITM2Q8N6M3 262 aa17.03■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM169BQ8N8A8 192 aa17.03■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRIP2Q9C0E4 1043 aa17.03■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 GLTPQ9NZD2 209 aa17.03■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 MOKQ9UQ07 419 aa17.03■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP23Q9Y6H3 246 aa17.03■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 ENPP4Q9Y6X5 453 aa17.03■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM107AO95990 144 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 CELA3BP08861 270 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 B4GALT1P15291 398 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTKP33981 857 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 C3orf36Q3SXR2 165 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 C11orf71Q6IPW1 123 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF813Q6ZN06 617 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASB10Q8WXI3 467 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF566Q969W8 418 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 BPIFA2Q96DR5 249 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q96MF0 132 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 FOXB1Q99853 325 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 KATNB1Q9BVA0 655 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 NOX3Q9HBY0 568 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 INIPQ9NRY2 104 aa17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms