RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 OR6N1Q8NGY5 312 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 KIF18AQ8NI77 898 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC25A36Q96CQ1 311 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 LRR1Q96L50 414 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 TCF7L1Q9HCS4 588 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 NOX4Q9NPH5 578 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNE5Q9UJ90 142 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 FZR1Q9UM11 496 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 NOTCH1P46531 2555 aa6.69□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 C5orf63A6NC05 138 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM247A6NEH6 219 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 J3QL48 77 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 M0R3G1 203 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 AP3D1O14617 1153 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 GPANK1O95872 356 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 SERPINA5P05154 406 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 PNMTP11086 282 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 NQO1P15559 274 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF250P15622 560 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF12P17014 697 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 TNFSF4P23510 183 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF81P51508 661 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 PGS1Q32NB8 556 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 LIN52Q52LA3 116 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 FRRS1Q6ZNA5 592 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 LINGO2Q7L985 606 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 LRP11Q86VZ4 500 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 UEVLDQ8IX04 471 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 ICA1LQ8NDH6 482 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 DEFB108BQ8NET1 73 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 TBC1D15Q8TC07 691 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 TWIST2Q8WVJ9 160 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC47A1Q96FL8 570 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 FMO2Q99518 471 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXB1Q99853 325 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 MECRQ9BV79 373 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 ULBP2Q9BZM5 246 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNN2Q9H2S1 579 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF121Q9H920 327 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 A4GALTQ9NPC4 353 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 B3GNT2Q9NY97 397 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 CALML5Q9NZT1 146 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF114Q9Y508 228 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 INSIG2Q9Y5U4 225 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 POMT1Q9Y6A1 747 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 SRRM5B3KS81 715 aa6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 MGRN1O60291 552 aa6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 PEX11AO75192 247 aa6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 TGDSO95455 350 aa6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 FGF4P08620 206 aa6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 VIMP08670 466 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 CSF1P09603 554 aa6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 SBK2P0C263 348 aa6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM157BP0CG42 384 aa6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 OR8G3PP0DMU2 310 aa6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 NR2F1P10589 423 aa6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 CPA3P15088 417 aa6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 TNFRSF1AP19438 455 aa6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 PMS2P3Q13401 168 aa6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 PTGR1Q14914 329 aa6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 TSTQ16762 297 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF718Q3SXZ3 478 aa6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC36A2Q495M3 483 aa6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM155Q4W5P6 130 aa6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 VAX1Q5SQQ9 334 aa6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM69AQ5T7M9 428 aa6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR157Q5UAW9 335 aa6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 IL23RQ5VWK5 629 aa6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 KANK2Q63ZY3 851 aa6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 ATG16L1Q676U5 607 aa6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF627Q7L945 461 aa6.67□□□□□ -1.34
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