RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 ALKBH2Q6NS38 261 aa19.53■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 OR4K5Q8NGD3 323 aa19.53■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 OR1K1Q8NGR3 316 aa19.53■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 OR13C2Q8NGS9 318 aa19.53■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 OR52N5Q8NH56 324 aa19.53■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 TMEM54Q969K7 222 aa19.53■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 PLPPR2Q96GM1 343 aa19.53■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 TMEM204Q9BSN7 226 aa19.53■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 MAGIXQ9H6Y5 334 aa19.53■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 CRLF2Q9HC73 371 aa19.53■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 TRAV27A0A087WT01 109 aa19.52■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 DPRXA6NFQ7 191 aa19.52■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 ZNF726A6NNF4 738 aa19.52■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 EFCAB9A8MZ26 197 aa19.52■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 M0R3G1 203 aa19.52■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 CLOCKO15516 846 aa19.52■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 PTP4A3O75365 173 aa19.52■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 KRT33AO76009 404 aa19.52■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 GADD45GO95257 159 aa19.52■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 PLAUP00749 431 aa19.52■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 ACKR1Q16570 336 aa19.52■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 HIKESHIQ53FT3 197 aa19.52■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 NCMAPQ5T1S8 102 aa19.52■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 ARMC4Q5T2S8 1044 aa19.52■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 ZER1Q7Z7L7 766 aa19.52■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 GPR137CQ8N3F9 429 aa19.52■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 C17orf78Q8N4C9 275 aa19.52■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 OR51A7Q8NH64 312 aa19.52■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 ZNF347Q96SE7 839 aa19.52■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 INIPQ9NRY2 104 aa19.52■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
SYF2-201ENST00000236273 BCL10O95999 233 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 PGA4P0DJD7 388 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 PGA3P0DJD8 388 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 SAGP10523 405 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 RRM2P31350 389 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 SLC9A3P48764 834 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 ARF1P84077 181 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 SPIBQ01892 262 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 TGFBR3Q03167 851 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 HIST3H3Q16695 136 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 CEACAM16Q2WEN9 425 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 HMBOX1Q6NT76 420 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 LRFN4Q6PJG9 635 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 OAFQ86UD1 273 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 ADGRG5Q8IZF4 528 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 ASB10Q8WXI3 467 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 SLC7A8Q9UHI5 535 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 POMPQ9Y244 141 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 AKAP9Q99996 3911 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 NPIPB13A6NJU9 1138 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 AQP12BA6NM10 295 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 NPIPB4C9JG80 1138 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 ATP5HO75947 161 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 SMIM11AP58511 58 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 FXYD6P3P58550 94 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 TBRG1Q3YBR2 411 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 ANKDD1AQ495B1 522 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 ALG10Q5BKT4 473 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 RRM2BQ7LG56 351 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 AQP12AQ8IXF9 295 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 CDK20Q8IZL9 346 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 OR4C15Q8NGM1 316 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 MUCL1Q96DR8 90 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 ALPK1Q96QP1 1244 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 VNN3Q9NY84 501 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 GLTPQ9NZD2 209 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 SIGLEC7Q9Y286 467 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa19.51■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PRG6 482 aa19.5■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 ZBED5Q49AG3 693 aa19.5■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 FBXW10Q5XX13 1052 aa19.5■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD16Q6P6B7 361 aa19.5■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 ZNF627Q7L945 461 aa19.5■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 SSX8Q7RTT4 187 aa19.5■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 IGFN1Q86VF2 1251 aa19.5■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 CANT1Q8WVQ1 401 aa19.5■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 TXNIPQ9H3M7 391 aa19.5■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 TMEM5Q9Y2B1 443 aa19.5■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 CCDC168Q8NDH2 2452 aa19.49■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 A0A096LPE4 126 aa19.49■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PPZ6 126 aa19.49■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 TRMUO75648 421 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 IGHMP01871 453 aa19.49■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 CSNK1A1P48729 337 aa19.49■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 NR1H2P55055 460 aa19.49■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 CHRNB3Q05901 458 aa19.49■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.3 ms