RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000171887.8

TNS1-201, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 10,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-201ENST00000171887 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 ADAM23O75077 832 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 ACRP10323 421 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 CDK5Q00535 292 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 SLC5A12Q1EHB4 618 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 ZNF620Q6ZNG0 422 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 TMEM18Q96B42 140 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 APIPQ96GX9 242 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 LPAR4Q99677 370 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 SLC30A3Q99726 388 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 SMOQ99835 787 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 CABLES2Q9BTV7 478 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 ABHD6Q9BV23 337 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 PISDQ9UG56 409 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 LHX6Q9UPM6 363 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 LCN6P62502 163 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 NPSR1Q6W5P4 371 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 C11orf42Q8N5U0 333 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 CLEC4DQ8WXI8 215 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 FAM53CQ9NYF3 392 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 FOCADQ5VW36 1801 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 SGK494L7N484 410 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 HSD17B6O14756 317 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 RABIFP47224 123 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 SLC11A1P49279 550 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 ADAM29Q9UKF5 820 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 ABCA4P78363 2273 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 SCG5P05408 212 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 VEZF1Q14119 521 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 SYT13Q7L8C5 426 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 TMEM123Q8N131 208 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 KLHDC1Q8N7A1 406 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 RHOXF1Q8NHV9 184 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 XKRY2A2RUG3 117 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 SLC16A7O60669 478 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 OR13C2Q8NGS9 318 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 OR10J5Q8NHC4 309 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 ST8SIA4Q92187 359 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 GORASP2Q9H8Y8 452 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 H3BQ06 376 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 GATMP50440 423 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 KRTDAPP60985 99 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 OR1Q1Q15612 314 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 ENTPD8Q5MY95 495 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 NUDT9Q9BW91 350 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 C10orf71Q711Q0 1435 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 SMIM17P0DL12 118 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 HHEXQ03014 270 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 TMEM97Q5BJF2 176 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 TOR2AQ5JU69 321 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 SPACA1Q9HBV2 294 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 TRAV20A0A0B4J274 112 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 PKDCCQ504Y2 493 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 DPPA4Q7L190 304 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 NKAIN3Q8N8D7 197 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.038e-9■■■■■ 48.8
TNS1-201ENST00000171887 SYT17Q9BSW7 474 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 DCTN6O00399 190 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 FIGLAQ6QHK4 219 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 RNF175Q8N4F7 328 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 ALG12Q9BV10 488 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 XYLT2Q9H1B5 865 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 EVA1AQ9H8M9 152 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 A0A1W2PQU0 124 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 G3V2L1 256 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 CTDSP2O14595 271 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 PFKMP08237 780 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 NME1P15531 152 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 SPINT3P49223 89 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 TPPP2P59282 170 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 KIAA1024LP59773 190 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 SLC17A1Q14916 467 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 OR2M7Q8NG81 312 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 ANGPTL6Q8NI99 470 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 ASB11Q8WXH4 323 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 SMIM12Q96EX1 92 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 TMEM200CA6NKL6 621 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 ZNF724A8MTY0 619 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 SPINT2O43291 252 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 OR5I1Q13606 314 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 CD276Q5ZPR3 534 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-201ENST00000171887 TVP23CQ96ET8 276 aa8.61□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms