RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639850.1

ME2-216, Transcript of malic enzyme 2, human

TSL 5 BASIC

Gene ME2, Length 2,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ME2-216	ENST00000639850	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		18.56	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		18.56	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	18.56	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	VDAC3	Q9Y277	283 aa		18.56	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		18.55	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	PSMD9	O00233	223 aa		18.55	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	PSMB10	P40306	273 aa		18.55	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	IDNK	Q5T6J7	187 aa		18.55	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		18.55	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	ARSK	Q6UWY0	536 aa		18.55	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	TPRA1	Q86W33	373 aa		18.55	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		18.55	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	RNF138	Q8WVD3	245 aa		18.55	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	TCEAL3	Q969E4	200 aa		18.55	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	18.55	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	NPAS1	Q99742	590 aa		18.55	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		18.55	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	TVP23A	A6NH52	213 aa		18.55	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850		C9J4A7	227 aa		18.55	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	APOA1	P02647	267 aa		18.55	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	18.55	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	18.55	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	ACKR1	Q16570	336 aa		18.55	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		18.55	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	SLC6A19	Q695T7	634 aa		18.55	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	LYPD8	Q6UX82	237 aa		18.55	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	TIGD4	Q8IY51	512 aa		18.55	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		18.55	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		18.55	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		18.55	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	18.55	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		18.55	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	18.55	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		18.54	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	NCOR1	O75376	2440 aa		18.54	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	PLPP3	O14495	311 aa		18.54	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	PCOLCE	Q15113	449 aa		18.54	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	HBM	Q6B0K9	141 aa		18.54	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		18.54	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		18.54	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	18.54	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	CD1A	P06126	327 aa		18.54	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	GP1BA	P07359	652 aa		18.54	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	IL7	P13232	177 aa		18.54	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	SPN	P16150	400 aa		18.54	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	MPL	P40238	635 aa		18.54	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	PYDC2	Q56P42	97 aa		18.54	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	CNIH2	Q6PI25	160 aa		18.54	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		18.54	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		18.54	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	CADM3	Q8N126	398 aa		18.54	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		18.54	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	TEX19	Q8NA77	164 aa		18.54	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		18.54	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	ELP5	Q8TE02	316 aa		18.54	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	RASL10B	Q96S79	203 aa		18.54	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	NEURL2	Q9BR09	285 aa		18.54	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		18.54	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		18.54	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		18.54	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		18.54	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	18.54	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		18.54	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		18.53	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	PRR32	B1ATL7	298 aa		18.53	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	FBXO45	P0C2W1	286 aa		18.53	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	MADCAM1	Q13477	382 aa		18.53	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		18.53	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	CDC20B	Q86Y33	519 aa		18.53	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	SETD6	Q8TBK2	473 aa		18.53	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		18.53	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	18.53	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		18.53	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		18.53	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	CFAP54	Q96N23	3096 aa		18.53	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		18.52	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	UMOD	P07911	640 aa		18.52	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	TACSTD2	P09758	323 aa		18.52	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	SP9	P0CG40	484 aa		18.52	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	ACP1	P24666	158 aa		18.52	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	MSX1	P28360	303 aa		18.52	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	EVX1	P49640	407 aa		18.52	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	NTRK2	Q16620	822 aa		18.52	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		18.52	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		18.52	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	ZNF519	Q8TB69	540 aa		18.52	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		18.52	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		18.52	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	PRSS37	A4D1T9	235 aa		18.52	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	PTGDS	P41222	190 aa		18.52	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	18.52	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	OR10A3	P58181	314 aa		18.52	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	FOXF1	Q12946	379 aa		18.52	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	18.52	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		18.52	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	OR6S1	Q8NH40	331 aa		18.52	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	18.52	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	ARL5B	Q96KC2	179 aa		18.52	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		18.52	■□□□□ 0.56
ME2-216	ENST00000639850	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		18.51	■□□□□ 0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms