RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 TTYH2Q9BSA4 534 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 IFT27Q9BW83 186 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 RIBC2Q9H4K1 309 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 RNF122Q9H9V4 155 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 INIPQ9NRY2 104 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 USE1Q9NZ43 259 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 EMC3Q9P0I2 261 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 B3GAT1Q9P2W7 334 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 REV1Q9UBZ9 1251 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 MEMO1Q9Y316 297 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 NOX1Q9Y5S8 564 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 CHD6Q8TD26 2715 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 E9PLN8 166 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 GPR171O14626 319 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 TOXO94900 526 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 PPP1R3DO95685 299 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 YES1P07947 543 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 IFNGR1P15260 489 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 AGTR1P30556 359 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 SLC6A6P31641 620 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 TIMP3P35625 211 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 SLC16A1P53985 500 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 RAD23AP54725 363 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 CLDN17P56750 224 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ERVK-25P63136 954 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 SIRPAP78324 504 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 MELKQ14680 651 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 PDK3Q15120 406 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 POU4F3Q15319 338 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM201Q5SNT2 666 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM211Q6ICI0 200 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 CREB3L2Q70SY1 520 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 SLC35D2Q76EJ3 337 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 FJX1Q86VR8 437 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 PARP8Q8N3A8 854 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 LRRC75AQ8NAA5 344 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 OR8D4Q8NGM9 314 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 TSPAN32Q96QS1 320 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 VKORC1Q9BQB6 163 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 KATNB1Q9BVA0 655 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 TSSK6Q9BXA6 273 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ENKD1Q9H0I2 346 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 VCXQ9H320 206 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 BCO1Q9HAY6 547 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 FANCFQ9NPI8 374 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 GLRX2Q9NS18 164 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 MED29Q9NX70 200 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 IL20Q9NYY1 176 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 A0A0G2JNJ9 132 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF724A8MTY0 619 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 LRRTM2O43300 516 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 SNAP29O95721 258 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 CD14P08571 375 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 NOS3P29474 1203 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 DAP3P51398 398 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 RPS6KA3P51812 740 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 CRISP1P54107 249 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 BIDP55957 195 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 RPL27P61353 136 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ESRRGP62508 458 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 FOXF2Q12947 444 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 SNCBQ16143 134 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ACKR1Q16570 336 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 NIPAL3Q6P499 406 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 CASP12Q6UXS9 341 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 AAED1Q7RTV5 226 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 IQCF1Q8N6M8 205 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 PACRGLQ8N7B6 248 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ZIC4Q8N9L1 334 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 NAXEQ8NCW5 288 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 OR2T33Q8NG76 320 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 OR4Q3Q8NH05 313 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-211ENST00000626236 ASB10Q8WXI3 467 aa7.56□□□□□ -1.2
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