RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 BRWD1Q9NSI6 2320 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 LRRC3CA6NJW4 275 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 SOX15O60248 233 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 POU3F4P49335 361 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ACSM1Q08AH1 577 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 APH1BQ8WW43 257 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 KCNK12Q9HB15 430 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 SRPK3Q9UPE1 567 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF217O75362 1048 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 LAMP1P11279 417 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 MTHFD2P13995 350 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ACKR3P25106 362 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ERVPABLB-1P60509 514 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 RPS23P62266 143 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 SEMG2Q02383 582 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 PLA1AQ53H76 456 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 CDS1Q92903 461 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 BABAM2Q9NXR7 383 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 HRH3Q9Y5N1 445 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 GPR45Q9Y5Y3 372 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 V9GYS6 101 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 A6NDN8 102 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 TCAPO15273 167 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 PTAFRP25105 342 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 G6PCP35575 357 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 GJA5P36382 358 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 WASP42768 502 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 HERVK_113P61574 105 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 CXADRP78310 365 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 AGBL4Q5VU57 503 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 FJX1Q86VR8 437 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 CDC20BQ86Y33 519 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 PRSS35Q8N3Z0 413 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 CSNK1A1LQ8N752 337 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 CRB3Q9BUF7 120 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 NRIP3Q9NQ35 241 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 PGAP2Q9UHJ9 254 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 OR2F2O95006 317 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 DCAF7P61962 342 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 RPS18P62269 152 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 OR2F1Q13607 317 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 NSDHLQ15738 373 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 AADACL3Q5VUY0 350 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 PODNL1Q6PEZ8 512 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 MUC15Q8N387 334 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 C12orf42Q96LP6 360 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 C1QBP02746 253 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ADRA2CP18825 462 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 RABGGTBP53611 331 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ETFRF1Q6IPR1 90 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 WDR73Q6P4I2 378 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 GPR26Q8NDV2 337 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 OR5B3Q8NH48 314 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 SLC35E1Q96K37 410 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 LPAR4Q99677 370 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 GSTO2Q9H4Y5 243 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 FAM186AA6NE01 2351 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 DUSP1P28562 367 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 GRM7Q14831 915 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 SPRED1Q7Z699 444 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 KLK6Q92876 244 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 S1PR3Q99500 378 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 G3V3Q6 166 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 STATHP02808 62 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 GABRR1P24046 479 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 HTR2CP28335 458 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 GPM6BQ13491 265 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ELOBQ15370 118 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ALKAL2Q6UX46 152 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 MSLNLQ96KJ4 702 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 KCNK15Q9H427 330 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 CLMPQ9H6B4 373 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 POLHQ9Y253 713 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 A0A0D9SEW6 157 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM218A2RU14 115 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 OR6C68A6NDL8 312 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 PTHLHP12272 177 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 CD1EP15812 388 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 FOLR3P41439 243 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ERVFC1P60507 584 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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