RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCDC58Q4VC31 144 aa10.71□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CHRDL2Q6WN34 429 aa10.71□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa10.71□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FCRLAQ7L513 359 aa10.71□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PM20D2Q8IYS1 436 aa10.71□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TCTE3Q8IZS6 198 aa10.71□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR8K3Q8NH51 312 aa10.71□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ULBP3Q9BZM4 244 aa10.71□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UCK1Q9HA47 277 aa10.71□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPATA2Q9UM82 520 aa10.71□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C2orf72A6NCS6 295 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NDUFB5O43674 189 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SCO2O43819 266 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GATBO75879 557 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IL12BP29460 328 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CSF2RBP32927 897 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GZMKP49863 264 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPS15P62841 145 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HSD11B2P80365 405 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EBPQ15125 230 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TIGD4Q8IY51 512 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR51A4Q8NGJ6 313 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 THEM6Q8WUY1 208 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PHF21AQ96BD5 680 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MAP6Q96JE9 813 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AMELYQ99218 206 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DPYSL5Q9BPU6 564 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ING3Q9NXR8 418 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ABRACLQ9P1F3 81 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RTTNQ86VV8 2226 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FRG2CA6NGY1 282 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IFITM5A6NNB3 132 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RAD1O60671 282 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UPK3AO75631 287 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PIAS2O75928 621 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TCRBP04435 133 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HIST1H2ABP04908 130 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRKCAP17252 672 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BCKDHBP21953 392 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CXCR1P25024 350 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CAPZA2P47755 286 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NXPH1P58417 271 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ISXQ2M1V0 245 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 YIF1BQ5BJH7 314 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OVCH1Q7RTY7 1134 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HIST1H2ACQ93077 130 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MS4A3Q96HJ5 214 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CACNG6Q9BXT2 260 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LIN7BQ9HAP6 207 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CTSFQ9UBX1 484 aa10.7□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PI4KAP42356 2102 aa10.69□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KIF26BQ2KJY2 2108 aa10.69□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CENPAP49450 140 aa10.69□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MMP15P51511 669 aa10.69□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IL10RAQ13651 578 aa10.69□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa10.69□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OGFOD3Q6PK18 319 aa10.69□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC35D2Q76EJ3 337 aa10.69□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LINGO2Q7L985 606 aa10.69□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC16A9Q7RTY1 509 aa10.69□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC35F3Q8IY50 421 aa10.69□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KDM8Q8N371 416 aa10.69□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC25A45Q8N413 288 aa10.69□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADAM19Q9H013 955 aa10.69□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF304Q9HCX3 659 aa10.69□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TAS2R5Q9NYW4 299 aa10.69□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LAMP5Q9UJQ1 280 aa10.69□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC6A5Q9Y345 797 aa10.69□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRABD2BA6NFA1 517 aa10.69□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP10.69□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADRA2CP18825 462 aa10.69□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ABCD3P28288 659 aa10.69□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GALNSP34059 522 aa10.69□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLCXD2Q0VAA5 305 aa10.69□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ETFDHQ16134 617 aa10.69□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARHGAP40Q5TG30 622 aa10.69□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRR23CQ6ZRP0 262 aa10.69□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LILRB4Q8NHJ6 448 aa10.69□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C1orf216Q8TAB5 229 aa10.69□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM174AQ8TBP5 190 aa10.69□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LIPHQ8WWY8 451 aa10.69□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC25A38Q96DW6 304 aa10.69□□□□□ -0.7
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms