RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602511.1

KDM5B-210, Transcript of lysine demethylase 5B, humanhuman

TSL 5

Gene KDM5B, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5B-210ENST00000602511 RPL27P61353 136 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 RAP1AP62834 184 aa7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 CDK5R2Q13319 367 aa7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 SNAPC1Q16533 368 aa7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 MS4A18Q3C1V0 323 aa7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 LINC00303Q3SY05 128 aa7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 KRTCAP3Q53RY4 240 aa7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 C6orf141Q5SZD1 244 aa7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 NXNL2Q5VZ03 156 aa7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 TMEM236Q5W0B7 351 aa7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 PM20D2Q8IYS1 436 aa7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 OR5M1Q8NGP8 315 aa7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 OR2V1Q8NHB1 315 aa7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 APH1BQ8WW43 257 aa7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 EXTL1Q92935 676 aa7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 SLC25A36Q96CQ1 311 aa7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 OXGR1Q96P68 337 aa7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 KATNB1Q9BVA0 655 aa7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 PRDM14Q9GZV8 571 aa7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 SLC6A15Q9H2J7 730 aa7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 TXNIPQ9H3M7 391 aa7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 RNF122Q9H9V4 155 aa7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 GP6Q9HCN6 339 aa7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 CLN6Q9NWW5 311 aa7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 SCN3BQ9NY72 215 aa7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF226Q9NYT6 803 aa7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 TVP23BQ9NYZ1 205 aa7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF175Q9Y473 711 aa7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 SVILO95425 2214 aa7.33□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 ALPK2Q86TB3 2170 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 A0A1W2PNR3 127 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 SLC22A31A6NKX4 558 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 SLC1A7O00341 560 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 TNFSF11O14788 317 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 PRODHO43272 600 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 PPP1R3DO95685 299 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 CELA3AP09093 270 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 FCGR2AP12318 317 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 ENPP1P22413 925 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 CRHBPP24387 322 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 SHC1P29353 583 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 RFC3P40938 356 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 SLC25A1P53007 311 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 CLDN20P56880 219 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 CARD18P57730 90 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 CTXN1P60606 82 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 HSF1Q00613 529 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.242e-7■■□□□ 12.5
KDM5B-210ENST00000602511 RNFT1Q5M7Z0 435 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 SLC35D3Q5M8T2 416 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 HBMQ6B0K9 141 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 FAM180AQ6UWF9 173 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 UEVLDQ8IX04 471 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 IQCF1Q8N6M8 205 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 OR10D3Q8NH80 312 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 MOSPD2Q8NHP6 518 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF519Q8TB69 540 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 ZPLD1Q8TCW7 415 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 SARAFQ96BY9 339 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 WBP1Q96G27 269 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 TSPAN32Q96QS1 320 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 UCN2Q96RP3 112 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 ALG12Q9BV10 488 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 ENKD1Q9H0I2 346 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 LDAHQ9H6V9 325 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 TMEM185BQ9H7F4 350 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 B3GAT1Q9P2W7 334 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 GRHPRQ9UBQ7 328 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.244e-7■■□□□ 13.2
KDM5B-210ENST00000602511 TPRKBQ9Y3C4 175 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 BSNQ9UPA5 3926 aa7.32□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa7.31□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 TRIM64CA6NLI5 447 aa7.31□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 CLCA1A8K7I4 914 aa7.31□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 NPIPA5E9PKD4 350 aa7.31□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 ERVH48-1M5A8F1 160 aa7.31□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 XKRYO14609 159 aa7.31□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
KDM5B-210ENST00000602511 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
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