RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600201.5

FCHO1-231, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 5

Gene FCHO1, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-231	ENST00000600201	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
FCHO1-231	ENST00000600201	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	MFN2	O95140	757 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	CRYAA	P02489	173 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	PATE4	P0C8F1	98 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	CBR1	P16152	277 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	GPX2	P18283	190 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	CAPZA2	P47755	286 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	PDLIM4	P50479	330 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	PIGF	Q07326	219 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	DUSP7	Q16829	419 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	PROX1	Q92786	737 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	SLC35B4	Q969S0	331 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	DOK1	Q99704	481 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	TPK1	Q9H3S4	243 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	C12orf10	Q9HB07	376 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	USP22	Q9UPT9	525 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	C11orf98	E9PRG8	122 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	FAM157C	P0CG43	387 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	B4GALT1	P15291	398 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	CRYBA2	P53672	197 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	SQLE	Q14534	574 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	MELK	Q14680	651 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	TRIP10	Q15642	601 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	EFNB3	Q15768	340 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	ULK3	Q6PHR2	472 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	SPATA21	Q7Z572	469 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	UEVLD	Q8IX04	471 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	ARHGDIG	Q99819	225 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	FZR1	Q9UM11	496 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	FKBP7	Q9Y680	259 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	GMEB1	Q9Y692	573 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201		B9A039	149 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	LMX1B	O60663	402 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	ERLIN1	O75477	346 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	TGDS	O95455	350 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	CD247	P20963	164 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	LRP11	Q86VZ4	500 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	CARM1	Q86X55	608 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	HIPK4	Q8NE63	616 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	NUP37	Q8NFH4	326 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	MCHR1	Q99705	422 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	PLPP3	O14495	311 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	OR2T1	O43869	369 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	STAMBP	O95630	424 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	CSF3	P09919	207 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	CD79A	P11912	226 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	TNFRSF1B	P20333	461 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	SLC6A2	P23975	617 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	PPOX	P50336	477 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	ATP4B	P51164	291 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	NCALD	P61601	193 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	12.8	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	PMS2P3	Q13401	168 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FCHO1-231	ENST00000600201	TAMM41	Q96BW9	452 aa		12.8	□□□□□ -0.36

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