RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 REV1Q9UBZ9 1251 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 V9GYY5 206 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1B0GWA3 101 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 TRPC5OSA6NMA1 111 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 CD79AP11912 226 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF35P13682 527 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 CFPP27918 469 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 EVX1P49640 407 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 PIGFQ07326 219 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 RGNQ15493 299 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 GSG1Q2KHT4 349 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 C6orf10Q5SRN2 563 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 GLCCI1Q86VQ1 547 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 WDFY1Q8IWB7 410 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 OR9I1Q8NGQ6 314 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 CLDND2Q8NHS1 167 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 SYT3Q9BQG1 590 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 EMC6Q9BV81 110 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 NARFLQ9H6Q4 476 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 A4GALTQ9NPC4 353 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 MS4A18H0YCH9 400 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 HPXP02790 462 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 PCMT1P22061 227 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 ALDH3B1P43353 468 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 MS4A18Q3C1V0 323 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR93Q6P2C0 686 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 C5orf46Q6UWT4 87 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 UEVLDQ8IX04 471 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 LSMEM1Q8N8F7 131 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD42Q8N9B4 389 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 BBS10Q8TAM1 723 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 CENPHQ9H3R5 247 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 LPAR2Q9HBW0 351 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 ZIM2Q9NZV7 527 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM157AC9JC47 383 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 WNT9BO14905 357 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 SNNO75324 88 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 COL8A2P25067 703 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 SEC24CP53992 1094 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 AQP5P55064 265 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 ALG10BQ5I7T1 473 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF813Q6ZN06 617 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 DEF8Q6ZN54 512 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 LRP11Q86VZ4 500 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 RACGAP1Q9H0H5 632 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 MED29Q9NX70 200 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF224Q9NZL3 707 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 BMP2P12643 396 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 B4GALT1P15291 398 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 NQO1P15559 274 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 GLRXP35754 106 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR4P57081 412 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF627Q7L945 461 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 MAVSQ7Z434 540 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM186Q96B77 213 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC41A3Q96GZ6 507 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 TXNDC15Q96J42 360 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 MS4A5Q9H3V2 200 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 THAP1Q9NVV9 213 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 HIF1ANQ9NWT6 349 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 FZR1Q9UM11 496 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A087WUJ7 227 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 CLIC1O00299 241 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 SAGP10523 405 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 PRKAR1BP31321 381 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 MFSD13AQ14CX5 517 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 FXNQ16595 210 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 HHATQ5VTY9 493 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC2A7Q6PXP3 512 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 NHLRC1Q6VVB1 395 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 GTF2H4Q92759 462 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 RDH5Q92781 318 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 YIPF5Q969M3 257 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 LRR1Q96L50 414 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 SPEF1Q9Y4P9 236 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 NOX1Q9Y5S8 564 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0A6YYJ9 748 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 SLCO1B7G3V0H7 640 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 BGLAPP02818 100 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-211ENST00000590874 MSMBP08118 114 aa22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms