RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 SC5DO75845 299 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 CEACAM4O75871 244 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 HLA-DQB1P01920 261 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC58Q4VC31 144 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 RHBDD2Q6NTF9 364 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 ADAM19Q9H013 955 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 MOKQ9UQ07 419 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 RELNP78509 3460 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 SNPHO15079 494 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 ALAS2P22557 587 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 OR1D4P47884 311 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 CCL11P51671 97 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 EBPQ15125 230 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 NNATQ16517 81 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF74Q16587 644 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 CDONQ4KMG0 1287 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 FAAH2Q6GMR7 532 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 PXKQ7Z7A4 578 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 NPEPL1Q8NDH3 523 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 HTRA1Q92743 480 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 TTYH2Q9BSA4 534 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 YIPF2Q9BWQ6 316 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 COPS7AQ9UBW8 275 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 MCIDASD6RGH6 385 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 TSPAN2O60636 221 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 RPL4P36578 427 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC16A1P53985 500 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 PNLIPRP2P54317 469 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 HBMQ6B0K9 141 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 DESI1Q6ICB0 168 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 OR1N1Q8NGS0 311 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 MIB2Q96AX9 1013 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 OR8D2Q9GZM6 311 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-204ENST00000587718 SEC16AO15027 2179 aa23.02■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 OR2W5A6NFC9 320 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 ALG1L2C9J202 215 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 CD14P08571 375 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 MYL9P24844 172 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 EVX1P49640 407 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 CD226Q15762 336 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 TRILQ7L0X0 811 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 TSLPQ969D9 159 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 C4orf36Q96KX1 117 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 MNTQ99583 582 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 NUDT9Q9BW91 350 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 FLNCQ14315 2725 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 PCSK5Q92824 1860 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 TMCC2O75069 709 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 NDUFAF6Q330K2 333 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC29A4Q7RTT9 530 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF441Q8N8Z8 693 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC75AQ8NAA5 344 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 CYB561A3Q8NBI2 242 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 OR4K13Q8NH42 304 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC22A4Q9H015 551 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 RNF32Q9H0A6 362 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 FKRPQ9H9S5 495 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 CLEC18AA5D8T8 446 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 CD8B2A6NJW9 211 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 GPRIN2O60269 458 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 GATBO75879 557 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 GLCEO94923 617 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 ASAH2BP0C7U1 165 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 CD8BP10966 210 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 IL12BP29460 328 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 RPS5P46782 204 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR139Q6DWJ6 353 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 CLEC18BQ6UXF7 455 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 B3GLCTQ6Y288 498 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC35F2Q8IXU6 374 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 CLEC18CQ8NCF0 446 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 SDR9C7Q8NEX9 313 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 ABHD4Q8TB40 342 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 TP53INP1Q96A56 240 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 RERGLQ9H628 205 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 MMP25Q9NPA2 562 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 C14orf119Q9NWQ9 140 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 HECTD1Q9ULT8 2610 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 MED13Q9UHV7 2174 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 CYSRT1A8MQ03 144 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 C9J4A7 227 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 J3QLW9 94 aa22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms