RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 KDM4DQ6B0I6 523 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 OPN5Q6U736 354 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF836Q6ZNA1 936 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 SLC51BQ86UW2 128 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 CLEC2DQ9UHP7 191 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 ADPRMQ3LIE5 342 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 MS4A4AQ96JQ5 239 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 CAMK2AQ9UQM7 478 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 MSTNO14793 375 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 UTS2O95399 124 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 SIX6O95475 246 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 AARDQ4LEZ3 155 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF684Q5T5D7 378 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 OR6T1Q8NGN1 323 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 MITD1Q8WV92 249 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 PRSS16Q9NQE7 514 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 I6L893 689 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 LBX1P52954 281 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 TAS2R30P59541 319 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 TGFBR3Q03167 851 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1B0GWA3 101 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 IL2RGP31785 369 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 CCR6P51684 374 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 KIAA1024LP59773 190 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 MSMO1Q15800 293 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 NPSR1Q6W5P4 371 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 STEAP1Q9UHE8 339 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 EBPQ15125 230 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 PLSCR5A0PG75 271 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 AGAP14A8MT82 685 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 FPR3P25089 353 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 SCARB1Q8WTV0 552 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 MARC2Q969Z3 335 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 RAB39BQ96DA2 213 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 C20orf85Q9H1P6 137 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM207Q6UWW9 146 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 FRMD1Q8N878 549 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 SGPP1Q9BX95 441 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 MYH4Q9Y623 1939 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 P2RY10O00398 339 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 KCNK2O95069 426 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 GABRA2P47869 451 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 VEGFBP49765 207 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 SLX4IPQ5VYV7 408 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 PRR14Q9BWN1 585 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 LIN7BQ9HAP6 207 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 RACK1P63244 317 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 AADACL3Q5VUY0 350 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 MED25Q71SY5 747 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 ST8SIA4Q92187 359 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 EMC9Q9Y3B6 208 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 SYT5O00445 386 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 TIGD3Q6B0B8 471 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 OR52W1Q6IF63 320 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 OLIG3Q7RTU3 272 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 TMED7Q9Y3B3 224 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 PAPLNO95428 1278 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 PCSK6P29122 969 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 SOHLH1Q5JUK2 328 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 C2CD4CQ8TF44 421 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 C10orf90Q96M02 699 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 OR11A1Q9GZK7 315 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 SDHAF2Q9NX18 166 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 WIF1Q9Y5W5 379 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 SLCO2B1O94956 709 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 C14orf79Q96F83 325 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 SELENOIQ9C0D9 397 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 RNF212BA8MTL3 300 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 HSPB6O14558 160 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 OMGP23515 440 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC26Q2I0M4 334 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 FAM71E1Q6IPT2 247 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 FAM213BQ8TBF2 198 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 ETV7Q9Y603 341 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 C20orf202A1L168 122 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 BCL6P41182 706 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 YPEL5P62699 121 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 CCSMST1Q4G0I0 132 aa19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms