RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 P2RY2P41231 377 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 CAV2P51636 162 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 NSDHLQ15738 373 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF674Q2M3X9 581 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 OLIG3Q7RTU3 272 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 OR2AK2Q8NG84 335 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 SLC22A8Q8TCC7 542 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa9.57□□□□□ -0.88
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PTPRM-205ENST00000577827 COL4A1P02462 1669 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 A0A1W2PR48 441 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 I3L1I5 382 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 F13BP05160 661 aa9.56□□□□□ -0.88
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PTPRM-205ENST00000577827 B4GALNT1Q00973 533 aa9.56□□□□□ -0.88
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PTPRM-205ENST00000577827 H3F3CQ6NXT2 135 aa9.56□□□□□ -0.88
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PTPRM-205ENST00000577827 NLRC3Q7RTR2 1065 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 CDH26Q8IXH8 852 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
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PTPRM-205ENST00000577827 C1orf123Q9NWV4 160 aa9.56□□□□□ -0.88
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PTPRM-205ENST00000577827 V9GYH0 126 aa9.56□□□□□ -0.88
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PTPRM-205ENST00000577827 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP9.56□□□□□ -0.88
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PTPRM-205ENST00000577827 LCN10Q6JVE6 187 aa9.55□□□□□ -0.88
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PTPRM-205ENST00000577827 CPNE7Q9UBL6 633 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 KPTNQ9Y664 436 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 PRSS44E7EML9 344 aa9.55□□□□□ -0.88
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