RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575909.1

TOM1L1-222, Transcript of target of myb1 like 1 membrane trafficking protein, human

TSL 3

Gene TOM1L1, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1L1-222	ENST00000575909	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	PDXP	Q96GD0	296 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	SENP8	Q96LD8	212 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	C9orf85	Q96MD7	179 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	CITED1	Q99966	193 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	ALG12	Q9BV10	488 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	NOTCH4	Q99466	2003 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	MIA2	Q96PC5	1412 aa		5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	TOR1A	O14656	332 aa		5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	PIGR	P01833	764 aa		5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	FAM228B	P0C875	321 aa		5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	BCKDHA	P12694	445 aa		5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	PVR	P15151	417 aa		5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	DTYMK	P23919	212 aa		5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	IGFBP5	P24593	272 aa		5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	CRABP1	P29762	137 aa		5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	LCN1	P31025	176 aa		5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	PCK1	P35558	622 aa		5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	TAS2R60	P59551	318 aa		5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	VSNL1	P62760	191 aa		5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	CHRNB3	Q05901	458 aa		5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	C14orf177	Q52M58	125 aa		5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	BEX5	Q5H9J7	111 aa		5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	LRRC66	Q68CR7	880 aa		5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	BORCS5	Q969J3	196 aa		5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	KIFC1	Q9BW19	673 aa		5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	TNR	Q92752	1358 aa		5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	NRCAM	Q92823	1304 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909		A0A1B0GUH1	482 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909		A0A1B0GVG6	124 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909		A0A1W2PPR1	153 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909		A8MX80	341 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	GPAA1	O43292	621 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF264	O43296	627 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	JCHAIN	P01591	159 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	HBQ1	P09105	142 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	LINC00614	P0C842	121 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	COX4I1	P13073	169 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	NQO2	P16083	231 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	CASP14	P31944	242 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	PKNOX1	P55347	436 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	HPCA	P84074	193 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	SELPLG	Q14242	412 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	DCST2	Q5T1A1	773 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	GPR107	Q5VW38	600 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	SNX20	Q7Z614	316 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	LUZP2	Q86TE4	346 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	VSTM4	Q8IW00	320 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	RFESD	Q8TAC1	157 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	NANP	Q8TBE9	248 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	TBCK	Q8TEA7	893 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	MYLPF	Q96A32	169 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	VGLL1	Q99990	258 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61

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