RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	FANK1	Q8TC84	345 aa		2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	FNDC8	Q8TC99	324 aa		2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	ISOC2	Q96AB3	205 aa		2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	BIRC7	Q96CA5	298 aa		2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	FAF2	Q96CS3	445 aa		2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	OR5B2	Q96R09	309 aa		2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	CHID1	Q9BWS9	393 aa		2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	UCK2	Q9BZX2	261 aa		2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	DERL2	Q9GZP9	239 aa		2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	PORCN	Q9H237	461 aa		2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	REEP4	Q9H6H4	257 aa		2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR54	Q9H977	334 aa		2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	KLK11	Q9UBX7	282 aa		2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	TMCO1	Q9UM00	188 aa		2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	COPS3	Q9UNS2	423 aa		2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		2.32	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A0G2JLW4	131 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1B0GTH9	108 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	PRSS37	A4D1T9	235 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	MSGN1	A6NI15	193 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	OR5B21	A6NL26	309 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	CENPBD1	B2RD01	187 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957		B4DXG7	233 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	C11orf98	E9PRG8	122 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	CLDN34	H7C241	214 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC19A2	O60779	497 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	ENTPD5	O75356	428 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	SH3BGRL	O75368	114 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP5H	O75947	161 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	GJB5	O95377	273 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	CD160	O95971	181 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	C2	P06681	752 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT7	P08729	469 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	STS	P08842	583 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	ABO	P16442	354 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	NPR2	P20594	1047 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	FAS	P25445	335 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	HTR2C	P28335	458 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	SSR4	P51571	173 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	EFNA3	P52797	238 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	CLDN6	P56747	220 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	CHRNB3	Q05901	458 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF33A	Q06730	810 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF33B	Q06732	778 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	DPYSL3	Q14195	570 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	TEAD2	Q15562	447 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	OR4D1	Q15615	310 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	ZBTB6	Q15916	424 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	TNXA	Q16473	311 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	DUSP7	Q16829	419 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF790	Q6PG37	636 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	NFE4	Q86UQ8	179 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	LSMEM2	Q8N112	164 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	SVOPL	Q8N434	492 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		2.31	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		2.31	□□□□□ -2.04

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