RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		12.15	□□□□□ -0.46
CS-231	ENST00000552222	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		12.15	□□□□□ -0.46
CS-231	ENST00000552222	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		12.15	□□□□□ -0.46
CS-231	ENST00000552222	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		12.14	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	AQP12B	A6NM10	295 aa		12.14	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	PRSS23	O95084	383 aa		12.14	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	THRB	P10828	461 aa		12.14	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	THBS2	P35442	1172 aa		12.14	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	DIO1	P49895	249 aa		12.14	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	TAS2R41	P59536	307 aa		12.14	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	EGR4	Q05215	589 aa		12.14	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	FLOT2	Q14254	428 aa		12.14	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	TAB1	Q15750	504 aa		12.14	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	SGCB	Q16585	318 aa		12.14	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		12.14	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		12.14	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		12.14	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	RNF217	Q8TC41	542 aa		12.14	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	MPP4	Q96JB8	637 aa		12.14	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	LRGUK	Q96M69	825 aa		12.14	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		12.14	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		12.14	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		12.14	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		12.14	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		12.14	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		12.14	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		12.14	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	ZNF175	Q9Y473	711 aa		12.14	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		12.13	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222		J3KTA2	159 aa		12.13	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	SULT2B1	O00204	365 aa		12.13	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	PMS2P2	O95744	297 aa		12.13	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	IMPDH2	P12268	514 aa		12.13	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	RHCE	P18577	417 aa		12.13	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		12.13	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		12.13	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		12.13	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	LIPT2	A6NK58	231 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	SHISA9	B4DS77	424 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	DNPH1	O43598	174 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	FZD7	O75084	574 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	VENTX	O95231	258 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	SYNGR4	O95473	234 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	PPP3CB	P16298	524 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	FUT4	P22083	530 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	IFNA8	P32881	189 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	MAGEA2	P43356	314 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	SPOCK1	Q08629	439 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	ST3GAL3	Q11203	375 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	LIPN	Q5VXI9	398 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	SEPHS2	Q99611	448 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	CAD	P27708	2225 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	AHSA1	O95433	338 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	FABP3	P05413	133 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	GPI	P06744	558 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	FCGR2A	P12318	317 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	OR2B6	P58173	313 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	SLC35A1	P78382	337 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	12.11	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	H3F3A	P84243	136 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	DEFA6	Q01524	100 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	GGTLC2	Q14390	218 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	TRAM2	Q15035	370 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		12.11	□□□□□ -0.47

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