RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 SLC35D2Q76EJ3 337 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 GPAT4Q86UL3 456 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 LRRC75AQ8NAA5 344 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 OR9K2Q8NGE7 335 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 OR6X1Q8NH79 312 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 CYGBQ8WWM9 190 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 TMEM45BQ96B21 275 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 RBP7Q96R05 134 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 TUBA1CQ9BQE3 449 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ALG12Q9BV10 488 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 KATNB1Q9BVA0 655 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 FN3KQ9H479 309 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 EGLN3Q9H6Z9 239 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 BCO1Q9HAY6 547 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 MED12Q93074 2177 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ZGRF1Q86YA3 2104 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 LRRN3E7EW58 273 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 E9PQ18 207 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 C11orf98E9PRG8 122 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 BHLHE40O14503 412 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 SLC19A2O60779 497 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 SOX14O95416 240 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 RENP00797 406 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 IL2RAP01589 272 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 IGHG1P01857 330 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 PTNP21246 168 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 P2RY4P51582 365 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 LGALS3BPQ08380 585 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 TMED1Q13445 227 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 MED21Q13503 144 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 STK11Q15831 433 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 SNAPC1Q16533 368 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ACKR1Q16570 336 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 TMEM201Q5SNT2 666 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 C1orf185Q5T7R7 199 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 C12orf73Q69YU5 71 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ZNF585AQ6P3V2 769 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 MTFR2Q6P444 385 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 DNM1P34Q6PK57 102 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 CREB3L2Q70SY1 520 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 JAZF1Q86VZ6 243 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ATCAYQ86WG3 371 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 KIF18BQ86Y91 864 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa8.31□□□□□ -1.08
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CS-220ENST00000550700 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
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CS-220ENST00000550700 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
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CS-220ENST00000550700 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 SRXN1Q9BYN0 137 aa8.31□□□□□ -1.08
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CS-220ENST00000550700 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 CMC2Q9NRP2 79 aa8.31□□□□□ -1.08
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CS-220ENST00000550700 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 KLHL13Q9P2N7 655 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 CLCF1Q9UBD9 225 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 EMC9Q9Y3B6 208 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 LRRC42Q9Y546 428 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 EPG5Q9HCE0 2579 aa8.31□□□□□ -1.08
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CS-220ENST00000550700 ZNF716A6NP11 495 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 HSPB2A8KAH6 182 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 E9PLN8 166 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 DLGAP1O14490 977 aa8.3□□□□□ -1.08
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CS-220ENST00000550700 F13BP05160 661 aa8.3□□□□□ -1.08
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CS-220ENST00000550700 CRABP1P29762 137 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ACVR1BP36896 505 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 PCYT1AP49585 367 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 FXYD6P3P58550 94 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ERVK-25P63136 954 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
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