RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538886.5

GGA3-202, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 3,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-202ENST00000538886 EPHX4Q8IUS5 362 aa7.97□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 OSTF1Q92882 214 aa7.97□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa7.97□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 ABCB9Q9NP78 766 aa7.97□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 NANSQ9NR45 359 aa7.97□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 ACOXLQ9NUZ1 547 aa7.97□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa7.97□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 LRRN3E7EW58 273 aa7.96□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 H7C2Y5 167 aa7.96□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 LINC01387J3KSC0 135 aa7.96□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 NKX2-2O95096 273 aa7.96□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 SOX14O95416 240 aa7.96□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 FOXF1Q12946 379 aa7.96□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 LACC1Q8IV20 430 aa7.96□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 C19orf18Q8NEA5 215 aa7.96□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 TSPEARQ8WU66 669 aa7.96□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 SLC7A6Q92536 515 aa7.96□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 HAS2Q92819 552 aa7.96□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 STACQ99469 402 aa7.96□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 ASIC5Q9NY37 505 aa7.96□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 COPS3Q9UNS2 423 aa7.96□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 PEX16Q9Y5Y5 336 aa7.96□□□□□ -1.13
GGA3-202ENST00000538886 H3BMH7 237 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 IGKV1D-16P01601 117 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 IGKV3-11P04433 115 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 S100A6P06703 90 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 GPR4P46093 362 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 ZNF45Q02386 682 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 RBBP4Q09028 425 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 PON3Q15166 354 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 FAM131AQ6UXB0 335 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 POMGNT2Q8NAT1 580 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 SYT14Q8NB59 555 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 KBTBD8Q8NFY9 601 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 OR6T1Q8NGN1 323 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 STON2Q8WXE9 905 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 TTC9Q92623 222 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 TMEM80Q96HE8 168 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 Q96MT0 163 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 DCAF16Q9NXF7 216 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 TMEM181Q9P2C4 612 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 ING4Q9UNL4 249 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 MED31Q9Y3C7 131 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 KMT2EQ8IZD2 1858 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 XKRYO14609 159 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 RD3LP0DJH9 198 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 ARAFP10398 606 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 ZNF117Q03924 483 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 SCN1BQ07699 218 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 CTF1Q16619 201 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 SPATS1Q496A3 300 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 TMEM201Q5SNT2 666 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 PYHIN1Q6K0P9 492 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 C17orf107Q6ZR85 190 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 C10orf111Q8N326 155 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 POGLUT1Q8NBL1 392 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 ZNF583Q96ND8 569 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 IL1RAPQ9NPH3 570 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 MGAT4BQ9UQ53 548 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa7.95□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 CADP27708 2225 aa7.95□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 ASPDHA6ND91 283 aa7.95□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 TRIM77I1YAP6 450 aa7.95□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 SUSD5O60279 629 aa7.95□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 ECDO95905 644 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 H1F0P07305 194 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 STSP08842 583 aa7.95□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 ZNF3P17036 446 aa7.95□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 P2RX1P51575 399 aa7.95□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 PMPCAQ10713 525 aa7.95□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 ST3GAL3Q11203 375 aa7.95□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 TRIQKQ629K1 86 aa7.95□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 XAF1Q6GPH4 301 aa7.95□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 CASP12Q6UXS9 341 aa7.95□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 ZNF836Q6ZNA1 936 aa7.95□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 PSMF1Q92530 271 aa7.95□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 ASPNQ9BXN1 380 aa7.95□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 SLC38A1Q9H2H9 487 aa7.95□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 IMPAD1Q9NX62 359 aa7.95□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 SLC23A1Q9UHI7 598 aa7.95□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 CSPG4Q6UVK1 2322 aa7.95□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 ZZEF1O43149 2961 aa7.95□□□□□ -1.14
GGA3-202ENST00000538886 A0A087WV48 116 aa7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms