RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	OR4F4	Q96R69	305 aa		3.32	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	TPPP3	Q9BW30	176 aa		3.32	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		3.32	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	JPT2	Q9H910	190 aa		3.32	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	UCK1	Q9HA47	277 aa		3.32	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	RDH14	Q9HBH5	336 aa		3.32	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	PALMD	Q9NP74	551 aa		3.32	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		3.32	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		3.32	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		3.32	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		3.32	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		3.32	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		3.32	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		3.32	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	POLE	Q07864	2286 aa		3.32	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	MED13L	Q71F56	2210 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	SEC16A	O15027	2179 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089		A0A0U1RQV5	110 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	LRIT2	A6NDA9	550 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089		E9PQ18	207 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089		K7EQG2	157 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	SGK494	L7N484	410 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	FGF1	P05230	155 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	THRB	P10828	461 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	PTPN4	P29074	926 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	ACTR1B	P42025	376 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	PTGFR	P43088	359 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	GNPDA1	P46926	289 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	NDUFA8	P51970	172 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	ACTR1A	P61163	376 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	NAAA	Q02083	359 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	FUT7	Q11130	342 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	CRMP1	Q14194	572 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	ACER2	Q5QJU3	275 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	REP15	Q6BDI9	236 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	EMB	Q6PCB8	327 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF599	Q96NL3	588 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	VPS35	Q96QK1	796 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	VGLL1	Q99990	258 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	TRIM15	Q9C019	465 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	FANCE	Q9HB96	536 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	ESM1	Q9NQ30	184 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	CENPM	Q9NSP4	180 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	GPR83	Q9NYM4	423 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	RDH8	Q9NYR8	311 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	F8	P00451	2351 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	SVIL	O95425	2214 aa		3.31	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	C11orf98	E9PRG8	122 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089		H0YL77	283 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	CASK	O14936	926 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	PALM	O75781	387 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	NDUFA7	O95182	113 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	CD160	O95971	181 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	IGHG1	P01857	330 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	MT-ND1	P03886	318 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	CALB1	P05937	261 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	TPM2	P07951	284 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	GPR1	P46091	355 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	UQCRFS1	P47985	274 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	MFAP2	P55001	183 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	TPI1	P60174	286 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	CD300C	Q08708	224 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-223	ENST00000536089	PNOC	Q13519	176 aa		3.3	□□□□□ -1.88

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