RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534730.5

BBS1-224, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 627 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-224	ENST00000534730	OR51A7	Q8NH64	312 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	FANK1	Q8TC84	345 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	UCK2	Q9BZX2	261 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	VCX	Q9H320	206 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730		Q9UFV3	132 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	MS4A18	H0YCH9	400 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730		H3BNX3	289 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	AHCYL1	O43865	530 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	PIP5K1C	O60331	668 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	KRT33A	O76009	404 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	MAK	P20794	623 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	PTN	P21246	168 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	P2RY4	P51582	365 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	GUSBP1	Q15486	140 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	RFX4	Q33E94	735 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	CASP12	Q6UXS9	341 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	SSX8	Q7RTT4	187 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	LRR1	Q96L50	414 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	FEV	Q99581	238 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	UPB1	Q9UBR1	384 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	RNF6	Q9Y252	685 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	FBN2	P35556	2912 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	C11orf98	E9PRG8	122 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	XKRY	O14609	159 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	IMPA2	O14732	288 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	KLF4	O43474	513 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	PTP4A3	O75365	173 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	SLC43A1	O75387	559 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	TOX	O94900	526 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	GAST	P01350	101 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	IGHG1	P01857	330 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	CD14	P08571	375 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	BMP5	P22003	454 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	ASCL1	P50553	236 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	RAD23A	P54725	363 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	TGFBR3	Q03167	851 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	KIF18B	Q86Y91	864 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	OR6X1	Q8NH79	312 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	EME1	Q96AY2	570 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	PKP2	Q99959	881 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	VCX3B	Q9H321	246 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	NTN4	Q9HB63	628 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	IL20	Q9NYY1	176 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	APC	P25054	2843 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	LRRN3	E7EW58	273 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730		M0R3G1	203 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	TNFSF13	O75888	250 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	CLDN14	O95500	239 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	IGHM	P01871	453 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	OSM	P13725	252 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	PAX7	P23759	505 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	NOS3	P29474	1203 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	AQP2	P41181	271 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	OR3A2	P47893	321 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	CLDN17	P56750	224 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	CTXN1	P60606	82 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	ESRRG	P62508	458 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	SIRPA	P78324	504 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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