RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531092.5

GMDS-AS1-208, humanhuman

TSL 3

Gene GMDS-AS1, Length 744 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SAGP10523 405 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 DRD4P21917 467 aa11.3□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PRTN3P24158 256 aa11.3□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 GCH1P30793 250 aa11.3□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SLC1A3P43003 542 aa11.3□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 DIO1P49895 249 aa11.3□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 IL13RA1P78552 427 aa11.3□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 MERTKQ12866 999 aa11.3□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SCARB2Q14108 478 aa11.3□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ADRM1Q16186 407 aa11.3□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TMPPEQ6ZT21 453 aa11.3□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CPLX4Q7Z7G2 160 aa11.3□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CMIPQ8IY22 773 aa11.3□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TMEM234Q8WY98 164 aa11.3□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ST8SIA1Q92185 356 aa11.3□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP11.3□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SLC38A2Q96QD8 506 aa11.3□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KATNB1Q9BVA0 655 aa11.3□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SH3PXD2BA1X283 911 aa11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 GMNCA6NCL1 334 aa11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 BBIP1A8MTZ0 92 aa11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 FXYD1O00168 92 aa11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 FRS3O43559 492 aa11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CCDC22O60826 627 aa11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PRSS23O95084 383 aa11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 WNT11O96014 354 aa11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 FSHBP01225 129 aa11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CRYAAP02489 173 aa11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 GKN3PP0CG01 181 aa11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 GPX2P18283 190 aa11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CCNA2P20248 432 aa11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 COL8A2P25067 703 aa11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 THBS4P35443 961 aa11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 IDH2P48735 452 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 NAAAQ02083 359 aa11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 HGFACQ04756 655 aa11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ZNF311Q5JNZ3 666 aa11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ELFN2Q5R3F8 820 aa11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CLIP4Q8N3C7 705 aa11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 NANPQ8TBE9 248 aa11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 RCN3Q96D15 328 aa11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 DUX5Q96PT3 197 aa11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PIF1Q9H611 641 aa11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ZNF442Q9H7R0 627 aa11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 BCL2L10Q9HD36 194 aa11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SLC7A10Q9NS82 523 aa11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ACER3Q9NUN7 267 aa11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ANGPT4Q9Y264 503 aa11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 GMEB1Q9Y692 573 aa11.29□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CDHR4A6H8M9 788 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CFAP73A6NFT4 308 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SULT2B1O00204 365 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 GPR171O14626 319 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SNX3O60493 162 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 DNAJA2O60884 412 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ADRA2AP08913 450 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 UQCRBP14927 111 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 NPR2P20594 1047 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SLC6A2P23975 617 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CALCRP30988 508 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SLC16A1P53985 500 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TGFBR3Q03167 851 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 HIKESHIQ53FT3 197 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 RABL3Q5HYI8 236 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 COQ5Q5HYK3 327 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TSPO2Q5TGU0 170 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 RNF220Q5VTB9 566 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 AP1ARQ63HQ0 302 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 REEP3Q6NUK4 255 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 C3orf33Q6P1S2 294 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ANKRD16Q6P6B7 361 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 GRINAQ7Z429 371 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KRT73Q86Y46 540 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PTOV1Q86YD1 416 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TREML1Q86YW5 311 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 C1QL4Q86Z23 238 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CDK20Q8IZL9 346 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CADM2Q8N3J6 435 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SYT14Q8NB59 555 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 C11orf65Q8NCR3 313 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 HIPK4Q8NE63 616 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 NUP37Q8NFH4 326 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 OR10A6Q8NH74 314 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PMM1Q92871 262 aa11.28□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 DNAJA3Q96EY1 480 aa11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms