RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507965.5

ATXN3-210, Transcript of ataxin 3, human

TSL 2

Gene ATXN3, Length 708 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-210	ENST00000507965	CALCR	P30988	508 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	MAGEA8	P43361	318 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	GZMK	P49863	264 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	PDLIM4	P50479	330 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	H3F3A	P84243	136 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	FOXL1	Q12952	345 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	SLC17A1	Q14916	467 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	ADIPOQ	Q15848	244 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	GPAT3	Q53EU6	434 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	SSX8	Q7RTT4	187 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	TMEM99	Q8N816	258 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	ANKFN1	Q8N957	763 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	ROPN1L	Q96C74	230 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	NELFA	Q9H3P2	528 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	FKRP	Q9H9S5	495 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	CA10	Q9NS85	328 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	UPB1	Q9UBR1	384 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	MID2	Q9UJV3	735 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	FKBP7	Q9Y680	259 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	DYSF	O75923	2080 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	DUXA	A6NLW8	204 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	NDUFS8	O00217	210 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	HMGN4	O00479	90 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	NR5A2	O00482	541 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	FRS3	O43559	492 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	DNPH1	O43598	174 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	ITM2A	O43736	263 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	LGI1	O95970	557 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	TGFA	P01135	160 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	LPL	P06858	475 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	CHRM4	P08173	479 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	CECR9	P0C854	216 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF23	P17027	643 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	HNF1A	P20823	631 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	MPG	P29372	298 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	CDKN2C	P42773	168 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	KHK	P50053	298 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	P2RY4	P51582	365 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	CLDN8	P56748	225 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	HPCA	P84074	193 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	CHRNB3	Q05901	458 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	BNIP2	Q12982	314 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	CEACAM7	Q14002	265 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	OR7A5	Q15622	319 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	TRIP10	Q15642	601 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	SYPL1	Q16563	259 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	SAXO2	Q658L1	398 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	RINL	Q6ZS11	566 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	AAED1	Q7RTV5	226 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	GPAT4	Q86UL3	456 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	TMEM45B	Q96B21	275 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-210	ENST00000507965	ARL8A	Q96BM9	186 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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