RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495588.2

GAPVD1-218, Transcript of GTPase activating protein and VPS9 domains 1, humanhuman

TSL 5

Gene GAPVD1, Length 274 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1-218ENST00000495588 HCRTR2O43614 444 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 NTN1O95631 604 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 BAG2O95816 211 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 CST1P01037 141 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 THY1P04216 161 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 P04436 131 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 CSF1P09603 554 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 ANPEPP15144 967 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 FASP25445 335 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 RRM2P31350 389 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 RYKP34925 604 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 PCP4P48539 62 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 DNASE1L1P49184 302 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 CCR4P51679 360 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 IST1P53990 364 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 UCNP55089 124 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 TMPRSS3P57727 454 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 RPP38P78345 283 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 ARG2P78540 354 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 SPIBQ01892 262 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 C17orf67Q0P5P2 114 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 EPS8Q12929 822 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 GANABQ14697 944 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 ATP6AP1Q15904 470 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 COL28A1Q2UY09 1125 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 ENTPD8Q5MY95 495 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 SLC30A6Q6NXT4 461 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF550Q7Z398 422 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 MISPQ8IVT2 679 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 C10orf67Q8IYJ2 551 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 EXD3Q8N9H8 876 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 WDSUB1Q8N9V3 476 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 MDS2Q8NDY4 140 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 CATSPER1Q8NEC5 780 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 DUSP19Q8WTR2 217 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 NTNG2Q96CW9 530 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 PRRC1Q96M27 445 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 MCHR1Q99705 422 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 ANGPTL4Q9BY76 406 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 LAT2Q9GZY6 243 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 DCLRE1BQ9H816 532 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 NTN4Q9HB63 628 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 VNN3Q9NY84 501 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 MED11Q9P086 117 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 RHCGQ9UBD6 479 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 RIMS3Q9UJD0 308 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 FBXL2Q9UKC9 423 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 ACAD8Q9UKU7 415 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 ICAM5Q9UMF0 924 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 A4GNTQ9UNA3 340 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 CSAG2Q9Y5P2 127 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 U3KQV3 271 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 PCNX3Q9H6A9 2034 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 URB1O60287 2271 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa4.94□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 A0A0B4J2E0 115 aa4.94□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 A0A1B0GX12 115 aa4.94□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 PINLYPA6NC86 204 aa4.94□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 K7EM74 188 aa4.94□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 PRYO14603 147 aa4.94□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 GNGT2O14610 69 aa4.94□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 NME2P1O60361 137 aa4.94□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP4.94□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 FMO6PO60774 539 aa4.94□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 PROP1O75360 226 aa4.94□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 SLC25A12O75746 678 aa4.94□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 C1QL1O75973 258 aa4.94□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 JTBO76095 146 aa4.94□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 NUDT14O95848 222 aa4.94□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 LINGO3P0C6S8 592 aa4.94□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 FCGR1AP12314 374 aa4.94□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 ITGA2P17301 1181 aa4.94□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 PTNP21246 168 aa4.94□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 IDH2P48735 452 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 TNFSF10P50591 281 aa4.94□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF84P51523 738 aa4.94□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 P2RX1P51575 399 aa4.94□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 CDH12P55289 794 aa4.94□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 TAS2R41P59536 307 aa4.94□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 SNTA1Q13424 505 aa4.94□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 OR1Q1Q15612 314 aa4.94□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 ZSWIM7Q19AV6 140 aa4.94□□□□□ -1.62
GAPVD1-218ENST00000495588 OR2T5Q6IEZ7 315 aa4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms