RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493976.1

AKAP9-215, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, human

TSL 3

Gene AKAP9, Length 724 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP9-215	ENST00000493976	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	OR2T1	O43869	369 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	HLA-H	P01893	362 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	ZNF23	P17027	643 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	STX1B	P61266	288 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	IL1RL1	Q01638	556 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	KRT80	Q6KB66	452 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	REEP3	Q6NUK4	255 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	SPATA21	Q7Z572	469 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	TXNDC15	Q96J42	360 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	C7orf26	Q96N11	449 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	ZNF75A	Q96N20	296 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	STAMBP	O95630	424 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	DAO	P14920	347 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	SRD5A1	P18405	259 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	NPR2	P20594	1047 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	PAX7	P23759	505 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	ARR3	P36575	388 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	CAPZA2	P47755	286 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	AQP5	P55064	265 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	SCARB2	Q14108	478 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	OR1Q1	Q15612	314 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	ULK3	Q6PHR2	472 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	UEVLD	Q8IX04	471 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	TPK1	Q9H3S4	243 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	GMEB1	Q9Y692	573 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP9-215	ENST00000493976	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976		M0R3H8	397 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	LILRA1	O75019	489 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	LYNX1	P0DP58	116 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	B4GALT1	P15291	398 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	GPX2	P18283	190 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	GIF	P27352	417 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	CDH12	P55289	794 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	DAG1	Q14118	895 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	TRIP10	Q15642	601 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	NPTX1	Q15818	432 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	PTOV1	Q86YD1	416 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	RNF217	Q8TC41	542 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	USP22	Q9UPT9	525 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	SERPINI2	O75830	405 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	TGFA	P01135	160 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	OPN1SW	P03999	348 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	THY1	P04216	161 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	NCALD	P61601	193 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	PIGF	Q07326	219 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	CAMK2D	Q13557	499 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	SELPLG	Q14242	412 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	KRT73	Q86Y46	540 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	SCAI	Q8N9R8	606 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	SMYD1	Q8NB12	490 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	OR6S1	Q8NH40	331 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	SNX18	Q96RF0	628 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	MFN2	O95140	757 aa		13.68	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	TGDS	O95455	350 aa		13.68	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	ADRA2A	P08913	450 aa		13.68	□□□□□ -0.22
AKAP9-215	ENST00000493976	TACSTD2	P09758	323 aa		13.68	□□□□□ -0.22

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