RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 OR5AK3PQ8NH89 298 aa5.56□□□□□ -1.52
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PRPF40A-210ENST00000489741 APOPT1Q96IL0 206 aa5.56□□□□□ -1.52
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PRPF40A-210ENST00000489741 ZIM3Q96PE6 472 aa5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 OR5B2Q96R09 309 aa5.56□□□□□ -1.52
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PRPF40A-210ENST00000489741 POLE3Q9NRF9 147 aa5.56□□□□□ -1.52
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PRPF40A-210ENST00000489741 CBLN4Q9NTU7 201 aa5.56□□□□□ -1.52
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PRPF40A-210ENST00000489741 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa5.56□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP5.56□□□□□ -1.526e-31■■■■■ 213
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PRPF40A-210ENST00000489741 FAM234BA2RU67 622 aa5.54□□□□□ -1.52
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PRPF40A-210ENST00000489741 CFLARO15519 480 aa5.54□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF208O43345 1280 aa5.54□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 RAD51DO75771 328 aa5.54□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 AGR2O95994 175 aa5.54□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 IGHV3-9P01782 118 aa5.54□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 C1QCP02747 245 aa5.54□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 DHRS4L1P0CG22 281 aa5.54□□□□□ -1.52
PRPF40A-210ENST00000489741 OR12D1P0DN82 309 aa5.54□□□□□ -1.52
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