RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STARD6P59095 220 aa14.14□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARHGAP40Q5TG30 622 aa14.14□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LURAP1LQ8IV03 231 aa14.14□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SERPINA12Q8IW75 414 aa14.14□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF671Q8TAW3 534 aa14.14□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RASD2Q96D21 266 aa14.14□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZDHHC12Q96GR4 267 aa14.14□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C12orf57Q99622 126 aa14.14□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SOSTQ9BQB4 213 aa14.14□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LANCL2Q9NS86 450 aa14.14□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FGF21Q9NSA1 209 aa14.14□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF175Q9Y473 711 aa14.14□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LINC00862A6NCI5 91 aa14.14□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FABP7O15540 132 aa14.14□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC19A2O60779 497 aa14.14□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FZD7O75084 574 aa14.14□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NUDT14O95848 222 aa14.14□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PITPNBP48739 271 aa14.14□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCR6P51684 374 aa14.14□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLDN12P56749 244 aa14.14□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SHBQ15464 509 aa14.14□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ODF4Q2M2E3 257 aa14.14□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C1QL3Q5VWW1 255 aa14.14□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DEFB123Q8N688 67 aa14.14□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF615Q8N8J6 731 aa14.14□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHRDQ9H2X0 955 aa14.14□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 APMAPQ9HDC9 416 aa14.14□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A0B4J2E0 115 aa14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A1B0GX12 115 aa14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ERVK-25P63136 954 aa14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NTRK2Q16620 822 aa14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RTL4Q6ZR62 310 aa14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BMPERQ8N8U9 685 aa14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 THAP4Q8WY91 577 aa14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LINC00052Q96N35 136 aa14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NUDT9Q9BW91 350 aa14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LILRA5A6NI73 299 aa14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACOD1A6NK06 481 aa14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRAMEF2O60811 474 aa14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAB3BP20337 219 aa14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DRD5P21918 477 aa14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EDNRAP25101 427 aa14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLDN20P56880 219 aa14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HSD11B2P80365 405 aa14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DGCR2P98153 550 aa14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MANEAQ5SRI9 462 aa14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF595Q8IYB9 648 aa14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CACNA1HO95180 2353 aa14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 F13BP05160 661 aa14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GDI2P50395 445 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACSM1Q08AH1 577 aa14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FCN2Q15485 313 aa14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TUSC1Q2TAM9 212 aa14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HES5Q5TA89 166 aa14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MARCH3Q86UD3 253 aa14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C9orf62Q8N4C0 152 aa14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MARVELD3Q96A59 401 aa14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MGAT4AQ9UM21 535 aa14.13□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A0A6YYJ9 748 aa14.12□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRAV20A0A0B4J274 112 aa14.12□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MASP2O00187 686 aa14.12□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHP2O43745 196 aa14.12□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ICOSLGO75144 302 aa14.12□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPANK1O95872 356 aa14.12□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATF1P18846 271 aa14.12□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GIFP27352 417 aa14.12□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ITPKBP27987 946 aa14.12□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC6A6P31641 620 aa14.12□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 THBS2P35442 1172 aa14.12□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZSWIM7Q19AV6 140 aa14.12□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MOSPD2Q8NHP6 518 aa14.12□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CEP76Q8TAP6 659 aa14.12□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC2A12Q8TD20 617 aa14.12□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C8orf44Q96CB5 159 aa14.12□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KLHL15Q96M94 604 aa14.12□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MOGAT1Q96PD6 335 aa14.12□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DERL3Q96Q80 235 aa14.12□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IER2Q9BTL4 223 aa14.12□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NIPAL2Q9H841 368 aa14.12□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYSLTR2Q9NS75 346 aa14.12□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WNT16Q9UBV4 365 aa14.12□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COPS3Q9UNS2 423 aa14.12□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa14.12□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SEC14L5O43304 696 aa14.12□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IFNGP01579 166 aa14.12□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MT-ND4P03905 459 aa14.12□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GLAP06280 429 aa14.12□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTHLHP12272 177 aa14.12□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATP12AP54707 1039 aa14.12□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CADM4Q8NFZ8 388 aa14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms