RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488612.5

RAD51B-212, Transcript of RAD51 paralog B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD51B, Length 1,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51B-212ENST00000488612 SLC16A1P53985 500 aa7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 CRISP1P54107 249 aa7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 CLDN17P56750 224 aa7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 LCN6P62502 163 aa7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 RBPJQ06330 500 aa7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 PMPCAQ10713 525 aa7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 COX10Q12887 443 aa7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 NPRL3Q12980 569 aa7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 PHYHD1Q5SRE7 291 aa7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 PTCHD4Q6ZW05 846 aa7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 SLC35D2Q76EJ3 337 aa7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 P4HA3Q7Z4N8 544 aa7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 PXKQ7Z7A4 578 aa7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 FJX1Q86VR8 437 aa7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 UEVLDQ8IX04 471 aa7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 PARP8Q8N3A8 854 aa7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 WNT2BQ93097 391 aa7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 Q96M85 177 aa7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 ZNF570Q96NI8 536 aa7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 IFT27Q9BW83 186 aa7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 TSSK6Q9BXA6 273 aa7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 GABARAPL3Q9BY60 117 aa7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 ZNF556Q9HAH1 456 aa7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 BCO1Q9HAY6 547 aa7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 INIPQ9NRY2 104 aa7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 TBC1D23Q9NUY8 699 aa7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 Q9UFV3 132 aa7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 RASD1Q9Y272 281 aa7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 MEMO1Q9Y316 297 aa7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa7.15□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 SLC35F4A4IF30 521 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 HTR3EA5X5Y0 456 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 TNFSF13O75888 250 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 ZNF432O94892 652 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 RCBTB2O95199 551 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 OR6A2O95222 327 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 CD14P08571 375 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 ZNF43P17038 809 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 AGTR1P30556 359 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 TIMP3P35625 211 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 GIPRP48546 466 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 BIDP55957 195 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 PRPS1P60891 318 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 SIRPAP78324 504 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 CDK5Q00535 292 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 CAMK2DQ13557 499 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 GINS1Q14691 196 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 POU4F3Q15319 338 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 CDSNQ15517 529 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 MESTQ5EB52 335 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 ARMC4Q5T2S8 1044 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 CARD17Q5XLA6 110 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 LINGO2Q7L985 606 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 GALNT11Q8NCW6 608 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 ANKK1Q8NFD2 765 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 PRR7Q8TB68 274 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 ZNF519Q8TB69 540 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 ASB10Q8WXI3 467 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 UBE2FQ969M7 185 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 GRIP2Q9C0E4 1043 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 C12orf49Q9H741 205 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 AASSQ9UDR5 926 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 FLNCQ14315 2725 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 HCFC1P51610 2035 aa7.14□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa7.13□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa7.13□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 ZAR1LA6NP61 321 aa7.13□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 E9PLN8 166 aa7.13□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 CCL21O00585 134 aa7.13□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 VAMP5O95183 116 aa7.13□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 IGHV3-9P01782 118 aa7.13□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 IGHMP01871 453 aa7.13□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 YES1P07947 543 aa7.13□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 GNAO1P09471 354 aa7.13□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 SLC6A6P31641 620 aa7.13□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 PTGER4P35408 488 aa7.13□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 ACVR1BP36896 505 aa7.13□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 RPL27P61353 136 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 ESRRGP62508 458 aa7.13□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 ADORA2A-AS1P86434 159 aa7.13□□□□□ -1.27
RAD51B-212ENST00000488612 MYBPC1Q00872 1141 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms