RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM99Q8N816 258 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR14A16Q8NHC5 309 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SELENOIQ9C0D9 397 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NTN4Q9HB63 628 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLXNB2O15031 1838 aa15.29■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CD1CP29017 333 aa15.28■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SIAH3Q8IW03 269 aa15.28■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa15.28■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM185AQ8NFB2 350 aa15.28■□□□□ 0.04
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BLACEA4D250 179 aa15.28■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SBK2P0C263 348 aa15.28■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF546Q86UE3 836 aa15.28■□□□□ 0.04
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR10A2Q9H208 303 aa15.28■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DUSP22Q9NRW4 184 aa15.28■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC6A14Q9UN76 642 aa15.28■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EDARQ9UNE0 448 aa15.28■□□□□ 0.04
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ASPDHA6ND91 283 aa15.28■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TLCD2A6NGC4 264 aa15.28■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FTCDNL1E5RQL4 147 aa15.28■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BSGP35613 385 aa15.28■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLDN17P56750 224 aa15.28■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYCSP99999 105 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EFCAB7A8K855 629 aa15.28■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PEX14O75381 377 aa15.28■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC46A1Q96NT5 459 aa15.28■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MICU1Q9BPX6 476 aa15.28■□□□□ 0.04
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRBOX4Q5JUW0 171 aa15.27■□□□□ 0.04
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C1orf198Q9H425 327 aa15.27■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 P2RY10O00398 339 aa15.27■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF749O43361 778 aa15.27■□□□□ 0.04
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TSSK2Q96PF2 358 aa15.27■□□□□ 0.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR2M2Q96R28 347 aa15.27■□□□□ 0.04
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EHFQ9NZC4 300 aa15.27■□□□□ 0.04
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LIPNQ5VXI9 398 aa15.27■□□□□ 0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BBS1Q8NFJ9 593 aa15.27■□□□□ 0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MED16Q9Y2X0 877 aa15.27■□□□□ 0.03
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBL3O95164 117 aa15.27■□□□□ 0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TCRBP04435 133 aa15.27■□□□□ 0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SERPINE2P07093 398 aa15.27■□□□□ 0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLDN6P56747 220 aa15.27■□□□□ 0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR52N1Q8NH53 320 aa15.27■□□□□ 0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FGF14Q92915 247 aa15.27■□□□□ 0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCNIP1Q9NZI2 227 aa15.27■□□□□ 0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DOCK3Q8IZD9 2030 aa15.27■□□□□ 0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZAR1LA6NP61 321 aa15.26■□□□□ 0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GLYATL3Q5SZD4 288 aa15.26■□□□□ 0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa15.26■□□□□ 0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM26EQ8N5C1 309 aa15.26■□□□□ 0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MRGPRX1Q96LB2 322 aa15.26■□□□□ 0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AP1S3Q96PC3 154 aa15.26■□□□□ 0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PFDN5Q99471 154 aa15.26■□□□□ 0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WDR76Q9H967 626 aa15.26■□□□□ 0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM212A6NML5 194 aa15.26■□□□□ 0.03
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