RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PMS2P2O95744 297 aa15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HBE1P02100 147 aa15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ERVFC1P60507 584 aa15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ISL1P61371 349 aa15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BTG1P62324 171 aa15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NLRP8Q86W28 1048 aa15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PSMF1Q92530 271 aa15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC39A13Q96H72 371 aa15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FKRPQ9H9S5 495 aa15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SMCO4Q9NRQ5 59 aa15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A0G2JNG1 304 aa15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KIR2DS3K7RE56 304 aa15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KITLGP21583 273 aa15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TACR3P29371 465 aa15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BDH1Q02338 343 aa15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KIR2DS5Q14953 304 aa15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ABHD17BQ5VST6 288 aa15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AADACL3Q5VUY0 350 aa15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM122BQ7Z309 247 aa15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR52H1Q8NGJ2 320 aa15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GFRA2O00451 464 aa15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C1QBP02746 253 aa15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SRMP19623 302 aa15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCR9P51686 369 aa15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TM4SF18Q96CE8 201 aa15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ENKD1Q9H0I2 346 aa15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FOLR3P41439 243 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MTCP1P56278 107 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SOHLH1Q5JUK2 328 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 Q6ZTK2 550 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C1orf198Q9H425 327 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM38AQ9H6F2 299 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 STMND1H3BQB6 276 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AIPO00170 330 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRAPPC2P0DI81 140 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRAPPC2BP0DI82 140 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FPR3P25089 353 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CTBSQ01459 385 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM41BQ5BJD5 291 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZMAT1Q5H9K5 638 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SHEQ5VZ18 495 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR10R2Q8NGX6 335 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HSD17B8Q92506 261 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SDHAF2Q9NX18 166 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PHIPQ8WWQ0 1821 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BHLHE40O14503 412 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP15.87■□□□□ 0.133e-7■□□□□ 8.4
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC36A2Q495M3 483 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM111BQ6SJ93 734 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FRMD1Q8N878 549 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ULBP2Q9BZM5 246 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SELENOIQ9C0D9 397 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 P2RY10O00398 339 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CBX7O95931 251 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MDGA2Q7Z553 956 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 VRK3Q8IV63 474 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RDH10Q8IZV5 341 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 YIPF5Q969M3 257 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UPRTQ96BW1 309 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C17orf112F2Z3M2 114 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 H0YGG7 62 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FOLR1P15328 257 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RAB38P57729 211 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CLINT1Q14677 625 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM201Q5SNT2 666 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RFLNAQ6ZTI6 216 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRR14Q9BWN1 585 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC23A2Q9UGH3 650 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SUSD2Q9UGT4 822 aa15.87■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NAGAP17050 411 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HLA-FP30511 346 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NUDT1P36639 197 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF610Q8N9Z0 462 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR5D18Q8NGL1 313 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM3DQ96BQ1 224 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR52A5Q9H2C5 316 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EMC9Q9Y3B6 208 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LRIT2A6NDA9 550 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SERINC4A6NH21 518 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PXDC1Q5TGL8 231 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KCNG3Q8TAE7 436 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GLIPR2Q9H4G4 154 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RNF212BA8MTL3 300 aa15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IL2RGP31785 369 aa15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms