RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474230.5

NFU1-209, Transcript of NFU1 iron-sulfur cluster scaffold, human

TSL 3

Gene NFU1, Length 666 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFU1-209	ENST00000474230	THAP9	Q9H5L6	903 aa		3.22	□□□□□ -1.89
NFU1-209	ENST00000474230	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		3.22	□□□□□ -1.89
NFU1-209	ENST00000474230	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		3.22	□□□□□ -1.89
NFU1-209	ENST00000474230	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		3.22	□□□□□ -1.89
NFU1-209	ENST00000474230	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		3.22	□□□□□ -1.89
NFU1-209	ENST00000474230	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
NFU1-209	ENST00000474230	NACA	E9PAV3	2078 aa		3.22	□□□□□ -1.89
NFU1-209	ENST00000474230	NOTCH2	Q04721	2471 aa		3.22	□□□□□ -1.89
NFU1-209	ENST00000474230	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
NFU1-209	ENST00000474230	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		3.22	□□□□□ -1.89
NFU1-209	ENST00000474230	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		3.22	□□□□□ -1.89
NFU1-209	ENST00000474230	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
NFU1-209	ENST00000474230	PTPRJ	Q12913	1337 aa		3.21	□□□□□ -1.89
NFU1-209	ENST00000474230	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	CLDN5	O00501	218 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	YKT6	O15498	198 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	GPX5	O75715	221 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	MMP23A	O75900	390 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	IGLV3-19	P01714	112 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	BCKDHA	P12694	445 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	CCR1	P32246	355 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	P2RY2	P41231	377 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	CAV2	P51636	162 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	PLK1	P53350	603 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	VLDLR	P98155	873 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	ZNF33A	Q06730	810 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	NEK5	Q6P3R8	708 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230		Q6ZS52	159 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	ARC	Q7LC44	396 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	TMEM110	Q86TL2	294 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	TMEM25	Q86YD3	366 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	RNF148	Q8N7C7	305 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	C12orf29	Q8N999	325 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	NELFB	Q8WX92	580 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	NEIL2	Q969S2	332 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	MCHR2	Q969V1	340 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	MARC2	Q969Z3	335 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	NICN1	Q9BSH3	213 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	SGK2	Q9HBY8	427 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	ANO10	Q9NW15	660 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	PTPRD	P23468	1912 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	TBL1X	O60907	577 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	APOE	P02649	317 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	ALPP	P05187	535 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	CISD3	P0C7P0	127 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	ALPPL2	P10696	532 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	CCDC130	P13994	396 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	IGLL1	P15814	213 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	ADORA2B	P29275	332 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	CASP1	P29466	404 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	PNOC	Q13519	176 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	LRRC31	Q6UY01	552 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	SCD5	Q86SK9	330 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	ALLC	Q8N6M5	410 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	OR2T3	Q8NH03	318 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NFU1-209	ENST00000474230	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		3.2	□□□□□ -1.9

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