RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 A8MX80 341 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 RENP00797 406 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHV2-5P01817 119 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 PIGRP01833 764 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 STSP08842 583 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 MGMTP16455 207 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC2A5P22732 501 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 RGRP47804 291 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 LCN2P80188 198 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 SERTAD2Q14140 314 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 SYCP1Q15431 976 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM30BQ3MIR4 351 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 C2CD6Q53TS8 623 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 GPR157Q5UAW9 335 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM122BQ7Z309 247 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC26A11Q86WA9 606 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 SKA3Q8IX90 412 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 PIANPQ8IYJ0 282 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 FBXO36Q8NEA4 188 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 OR5B3Q8NH48 314 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC26Q8TAB7 109 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 MYDGFQ969H8 173 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 PGLYRP4Q96LB8 373 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 ECSITQ9BQ95 431 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 GBA3Q9H227 469 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 ADNPQ9H2P0 1102 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 LY9Q9HBG7 655 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 RETNQ9HD89 108 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 MIEF1Q9NQG6 463 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 DPM3Q9P2X0 92 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 MMP17Q9ULZ9 603 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 PRSS37A4D1T9 235 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 CDC7O00311 574 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 ZBTB5O15062 677 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF254O75437 659 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 EEDO75530 441 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF432O94892 652 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 CLIC3O95833 236 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 IL2RGP31785 369 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 RORAP35398 523 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 CFHR2P36980 270 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 NCF4Q15080 339 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 MARCH8Q5T0T0 291 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 C6orf183Q5T699 404 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 SPESP1Q6UW49 350 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 Q6ZN92 141 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 ARCQ7LC44 396 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 COMTD1Q86VU5 262 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 PDIK1LQ8N165 341 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 OR56A4Q8NGH8 313 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 ITLN1Q8WWA0 313 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 VOPP1Q96AW1 172 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 C9orf72Q96LT7 481 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNS3Q9BQ31 491 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 SYT11Q9BT88 431 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF126Q9BV68 326 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 PIGUQ9H490 435 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 CWH43Q9H720 699 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 NTN4Q9HB63 628 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 HRASLS2Q9NWW9 162 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 SAR1BQ9Y6B6 198 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 CNTNAP1P78357 1384 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAV6A0A075B6T7 132 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 HSBP1O75506 76 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 FARS2O95363 451 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 TBPP20226 339 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 PMCHP20382 165 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP6V1B2P21281 511 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 CCNOP22674 350 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 TNFSF9P41273 254 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 NPBWR2P48146 333 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 SSR4P51571 173 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 XRCC4Q13426 336 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 GPR176Q14439 515 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 PDPK2PQ6A1A2 396 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 ASCL4Q6XD76 172 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 NR2C2APQ86WQ0 139 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 PRR22Q8IZ63 422 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 CXorf40AQ8TE69 158 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 SMARCD2Q92925 531 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 NRBF2Q96F24 287 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 POM121L2Q96KW2 1035 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-209ENST00000473406 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.8 ms