RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 CYTH1Q15438 398 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-207ENST00000470201 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-207ENST00000470201 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-207ENST00000470201 OFCC1Q8IZS5 231 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-207ENST00000470201 CEND1Q8N111 149 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-207ENST00000470201 LINC00612Q8N6U2 182 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF740Q8NDX6 193 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-207ENST00000470201 OR6C4Q8NGE1 309 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-207ENST00000470201 OR2G2Q8NGZ5 317 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-207ENST00000470201 KIFAP3Q92845 792 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-207ENST00000470201 B3GALT6Q96L58 329 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-207ENST00000470201 MAGEB18Q96M61 343 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM246Q9BRR3 403 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-207ENST00000470201 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-207ENST00000470201 EXD2Q9NVH0 621 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-207ENST00000470201 PSME2Q9UL46 239 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-207ENST00000470201 C12orf77C9JDV5 145 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 E7ENQ6 273 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 RAB29O14966 203 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 MMP23AO75900 390 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 BBOX1O75936 387 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 OR2F2O95006 317 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 TSPAN13O95857 204 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 OR8G3PP0DMU2 310 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 GABRR1P24046 479 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 RORAP35398 523 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 NPBWR2P48146 333 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 RAB9AP51151 201 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 APOC4P55056 127 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 GPX6P59796 221 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 RAB10P61026 200 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 CASC10Q5T4H9 136 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 LCE1FQ5T754 118 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 GPR157Q5UAW9 335 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 C9orf135Q5VTT2 229 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 SPINK14Q6IE38 97 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 CLEC2AQ6UVW9 174 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 SSX9Q7RTT3 188 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 COMMD1Q8N668 190 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 NEIL3Q8TAT5 605 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 UCN3Q969E3 161 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 MARC2Q969Z3 335 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC126Q96EE4 140 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 C16orf74Q96GX8 76 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 OR51J1Q9H342 316 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 CRLF2Q9HC73 371 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 CALYQ9NYX4 217 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 CDH10Q9Y6N8 788 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 TTC41PQ6P2S7 1318 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 USP47Q96K76 1375 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 C12orf71A8MTZ7 269 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 FOXN2P32314 431 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 RGRP47804 291 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 UGT2B15P54855 530 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 GPNMBQ14956 572 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 NSDHLQ15738 373 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 VAX1Q5SQQ9 334 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM220Q6QAJ8 160 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 CERS6Q6ZMG9 384 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF836Q6ZNA1 936 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF620Q6ZNG0 422 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 RFLNAQ6ZTI6 216 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 ASCL5Q7RTU5 278 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 LHFPL3Q86UP9 236 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 PRR22Q8IZ63 422 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 VN1R2Q8NFZ6 395 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 OR1S2Q8NGQ3 325 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 NRGNQ92686 78 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 PLEKHF1Q96S99 279 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 ATP5SQ99766 215 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 BPIFA3Q9BQP9 254 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 ROGDIQ9GZN7 287 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 SIAEQ9HAT2 523 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 ABCA7Q8IZY2 2146 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 PSMB11A5LHX3 300 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 L7N2F9 121 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 AIM2O14862 343 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 PPP1R2P9O14990 202 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 HDAC3O15379 428 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 CHST1O43916 411 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 ANXA5P08758 320 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 FMO3P31513 532 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 TMED10P49755 219 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms